RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382940.8

NME4-202, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene NME4, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-202ENST00000382940 ZNF541Q9H0D2 1346 aa27.84■■■□□ 2.05
NME4-202ENST00000382940 PPIP5K2O43314 1243 aa27.83■■■□□ 2.05
NME4-202ENST00000382940 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
NME4-202ENST00000382940 EIF6P56537 245 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
NME4-202ENST00000382940 WDR90Q96KV7 1748 aa27.82■■■□□ 2.04
NME4-202ENST00000382940 POTECB2RU33 542 aa27.82■■■□□ 2.04
NME4-202ENST00000382940 FZD9O00144 591 aa27.82■■■□□ 2.04
NME4-202ENST00000382940 G2E3Q7L622 706 aa27.82■■■□□ 2.04
NME4-202ENST00000382940 NIM1KQ8IY84 436 aa27.82■■■□□ 2.04
NME4-202ENST00000382940 MPNDQ8N594 471 aa27.82■■■□□ 2.04
NME4-202ENST00000382940 VAMP4O75379 141 aa27.81■■■□□ 2.04
NME4-202ENST00000382940 FLIIQ13045 1269 aa27.81■■■□□ 2.04
NME4-202ENST00000382940 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
NME4-202ENST00000382940 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
NME4-202ENST00000382940 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
NME4-202ENST00000382940 LAMB2P55268 1798 aa27.79■■■□□ 2.04
NME4-202ENST00000382940 AOC3Q16853 763 aa27.79■■■□□ 2.04
NME4-202ENST00000382940 CCDC152Q4G0S7 254 aa27.79■■■□□ 2.04
NME4-202ENST00000382940 GPC2Q8N158 579 aa27.79■■■□□ 2.04
NME4-202ENST00000382940 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
NME4-202ENST00000382940 VPS33BQ9H267 617 aa27.79■■■□□ 2.04
NME4-202ENST00000382940 PDE8AO60658 829 aa27.78■■■□□ 2.04
NME4-202ENST00000382940 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
NME4-202ENST00000382940 GJA3Q9Y6H8 435 aa27.78■■■□□ 2.04
NME4-202ENST00000382940 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
NME4-202ENST00000382940 IGKV5-2P06315 115 aa27.77■■■□□ 2.04
NME4-202ENST00000382940 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
NME4-202ENST00000382940 HACL1Q9UJ83 578 aa27.77■■■□□ 2.04
NME4-202ENST00000382940 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
NME4-202ENST00000382940 RPS8P62241 208 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
NME4-202ENST00000382940 CDHR2Q9BYE9 1310 aa27.74■■■□□ 2.03
NME4-202ENST00000382940 NEURL1BA8MQ27 555 aa27.74■■■□□ 2.03
NME4-202ENST00000382940 DNAAF4Q8WXU2 420 aa27.74■■■□□ 2.03
NME4-202ENST00000382940 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
NME4-202ENST00000382940 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
NME4-202ENST00000382940 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
NME4-202ENST00000382940 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
NME4-202ENST00000382940 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
NME4-202ENST00000382940 CHADLQ6NUI6 762 aa27.73■■■□□ 2.03
NME4-202ENST00000382940 ZNF521Q96K83 1311 aa27.72■■■□□ 2.03
NME4-202ENST00000382940 KIAA2012Q0VF49 1180 aa27.72■■■□□ 2.03
NME4-202ENST00000382940 SEC31BQ9NQW1 1179 aa27.72■■■□□ 2.03
NME4-202ENST00000382940 ZNRF3Q9ULT6 936 aa27.72■■■□□ 2.03
NME4-202ENST00000382940 COL4A5P29400 1685 aa27.72■■■□□ 2.03
NME4-202ENST00000382940 CEP350Q5VT06 3117 aa27.71■■■□□ 2.03
NME4-202ENST00000382940 CCER2I3L3R5 266 aa27.71■■■□□ 2.03
NME4-202ENST00000382940 EPHX2P34913 555 aa27.71■■■□□ 2.03
NME4-202ENST00000382940 CTSWP56202 376 aa27.71■■■□□ 2.03
NME4-202ENST00000382940 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa27.71■■■□□ 2.03
NME4-202ENST00000382940 C6orf229H3BNL8 230 aa27.7■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 LDHDQ86WU2 507 aa27.7■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 LINS1Q8NG48 757 aa27.7■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 CLEC11AQ9Y240 323 aa27.7■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 E9PSI1 815 aa27.69■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 POTEIP0CG38 1075 aa27.69■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 POTEJP0CG39 1038 aa27.69■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 GCKRQ14397 625 aa27.69■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 WASHC4Q2M389 1173 aa27.69■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 GPSM2P81274 684 aa27.68■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa27.68■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 EYA3Q99504 573 aa27.68■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa27.68■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 H7C1W4 665 aa27.66■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 HTRA3P83110 453 aa27.66■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 SCN4AP35499 1836 aa27.66■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 F6X3S4 739 aa27.65■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 LRRC37AA6NMS7 1700 aa27.64■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 TAF1P21675 1872 aa27.64■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 RIMBP2O15034 1052 aa27.64■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 CXCL9Q07325 125 aa27.64■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 TNIP1Q15025 636 aa27.64■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 CIAPIN1Q6FI81 312 aa27.64■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 TTLL11Q8NHH1 800 aa27.64■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 POLLQ9UGP5 575 aa27.64■■■□□ 2.02
NME4-202ENST00000382940 RAD17O75943 681 aa27.63■■■□□ 2.01
NME4-202ENST00000382940 UFL1O94874 794 aa27.63■■■□□ 2.01
NME4-202ENST00000382940 GREM2Q9H772 168 aa27.63■■■□□ 2.01
NME4-202ENST00000382940 DUOX1Q9NRD9 1551 aa27.62■■■□□ 2.01
NME4-202ENST00000382940 G3V3G9 751 aa27.62■■■□□ 2.01
NME4-202ENST00000382940 SCNN1DP51172 638 aa27.62■■■□□ 2.01
NME4-202ENST00000382940 DCAF8Q5TAQ9 597 aa27.62■■■□□ 2.01
NME4-202ENST00000382940 TBC1D16Q8TBP0 767 aa27.62■■■□□ 2.01
NME4-202ENST00000382940 BCL2L13Q9BXK5 485 aa27.62■■■□□ 2.01
NME4-202ENST00000382940 GGA1Q9UJY5 639 aa27.62■■■□□ 2.01
NME4-202ENST00000382940 COL4A1P02462 1669 aa27.62■■■□□ 2.01
NME4-202ENST00000382940 EPS15P42566 896 aa27.61■■■□□ 2.01
NME4-202ENST00000382940 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
NME4-202ENST00000382940 DBNDD1Q9H9R9 158 aa27.61■■■□□ 2.01
NME4-202ENST00000382940 PODXL2Q9NZ53 605 aa27.61■■■□□ 2.01
NME4-202ENST00000382940 SLC4A10Q6U841 1118 aa27.6■■■□□ 2.01
NME4-202ENST00000382940 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa27.6■■■□□ 2.01
NME4-202ENST00000382940 RTL9Q8NET4 1388 aa27.6■■■□□ 2.01
NME4-202ENST00000382940 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
NME4-202ENST00000382940 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
NME4-202ENST00000382940 SLFN5Q08AF3 891 aa27.59■■■□□ 2.01
NME4-202ENST00000382940 BEND3Q5T5X7 828 aa27.59■■■□□ 2.01
NME4-202ENST00000382940 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
NME4-202ENST00000382940 PLA2G12BQ9BX93 195 aa27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.4 ms