RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371417.3

ARRDC1-AS1-201, ARRDC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ARRDC1-AS1, Length 1,409 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CCDC152Q4G0S7 254 aa27.37■■□□□ 1.97
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GREM2Q9H772 168 aa27.36■■□□□ 1.97
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CD2APQ9Y5K6 639 aa27.36■■□□□ 1.97
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MTX1Q13505 466 aa27.35■■□□□ 1.97
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CEP85Q6P2H3 762 aa27.35■■□□□ 1.97
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 C2CD5Q86YS7 1000 aa27.35■■□□□ 1.97
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CHMP3Q9Y3E7 222 aa27.35■■□□□ 1.97
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SRGNP10124 158 aa27.34■■□□□ 1.97
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ATP8B2P98198 1209 aa27.34■■□□□ 1.97
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FAM161AQ3B820 660 aa27.34■■□□□ 1.97
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 KLHL34Q8N239 644 aa27.34■■□□□ 1.97
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27.34■■□□□ 1.97
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa27.34■■□□□ 1.97
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RTL9Q8NET4 1388 aa27.34■■□□□ 1.97
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 H0YIN7 160 aa27.33■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CHRNA5P30532 468 aa27.33■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TGFB2P61812 414 aa27.33■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa27.32■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SRGAP3O43295 1099 aa27.32■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SEC31BQ9NQW1 1179 aa27.32■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NPR1P16066 1061 aa27.31■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ITGA6P23229 1130 aa27.31■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SIRT2Q8IXJ6 389 aa27.31■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa27.31■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 LRP5O75197 1615 aa27.3■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa27.3■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DPEP1P16444 411 aa27.3■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CCDC57Q2TAC2 916 aa27.3■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MASTLQ96GX5 879 aa27.3■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 A0A0G2JLW4 131 aa27.29■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa27.29■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SSH3Q8TE77 659 aa27.29■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 POLA2Q14181 598 aa27.28■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 STYK1Q6J9G0 422 aa27.28■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CRAMP1Q96RY5 1269 aa27.28■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 KCNA3P22001 575 aa27.27■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP27.27■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 COL4A1P02462 1669 aa27.27■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DLEC1Q9Y238 1755 aa27.27■■□□□ 1.96
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TAF1P21675 1872 aa27.26■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GRAPQ13588 217 aa27.25■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NLGN2Q8NFZ4 835 aa27.25■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 KLHDC4Q8TBB5 520 aa27.25■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ALDH1B1P30837 517 aa27.24■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ERICH6BQ5W0A0 696 aa27.24■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 HMMRO75330 724 aa27.24■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RPS8P62241 208 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SYT17Q9BSW7 474 aa27.24■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 COPRSQ9NQ92 184 aa27.24■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TAF7LQ5H9L4 462 aa27.23■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa27.23■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CNKSR1Q969H4 720 aa27.23■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 BBOX1O75936 387 aa27.21■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PIM2Q9P1W9 311 aa27.21■■□□□ 1.95
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TTLL6Q8N841 843 aa27.2■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MPHOSPH8Q99549 860 aa27.19■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa27.18■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SIL1Q9H173 461 aa27.18■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SPEF2Q9C093 1822 aa27.18■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SURF6O75683 361 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CACNA1SQ13698 1873 aa27.17■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SLX4Q8IY92 1834 aa27.17■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 EYA2O00167 538 aa27.16■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 LRRC24Q50LG9 513 aa27.16■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CNNM1Q9NRU3 951 aa27.16■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FBXO3Q9UK99 471 aa27.16■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 IGHDP01880 384 aa27.16■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TMC4Q7Z404 712 aa27.16■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 WWC3Q9ULE0 1092 aa27.16■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CIAO1O76071 339 aa27.15■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ATG9AQ7Z3C6 839 aa27.15■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SLC51AQ86UW1 340 aa27.15■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 DCTPP1Q9H773 170 aa27.15■■□□□ 1.94
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 149.5 ms