RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330334.7

HDDC3-201, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-201ENST00000330334 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 PPIP5K2O43314 1243 aa22.86■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 POTEIP0CG38 1075 aa22.86■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 POTEJP0CG39 1038 aa22.86■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 EPHX2P34913 555 aa22.86■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 WDR63Q8IWG1 891 aa22.86■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 NIM1KQ8IY84 436 aa22.86■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 COL4A5P29400 1685 aa22.85■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 LAMB2P55268 1798 aa22.84■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 MYD88Q99836 296 aa22.84■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 STK31Q9BXU1 1019 aa22.84■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.83■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 AOC3Q16853 763 aa22.83■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 KSR2Q6VAB6 950 aa22.83■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF428Q96B54 188 aa22.83■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.83■■□□□ 1.25
HDDC3-201ENST00000330334 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.82■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 PASKQ96RG2 1323 aa22.82■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 CREBZFQ9NS37 354 aa22.81■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.81■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 PCNTO95613 3336 aa22.81■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.8■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 SCNN1DP51172 638 aa22.8■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.8■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 CXCL9Q07325 125 aa22.79■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 PDE8AO60658 829 aa22.78■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 SLC4A2P04920 1241 aa22.78■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.78■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.78■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 IGKV5-2P06315 115 aa22.77■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.77■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.77■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.77■■□□□ 1.24
HDDC3-201ENST00000330334 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.76■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 EPS15P42566 896 aa22.76■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 TNIP1Q15025 636 aa22.76■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 CNTROBQ8N137 903 aa22.76■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.75■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 VAMP4O75379 141 aa22.75■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 WASHC4Q2M389 1173 aa22.75■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.75■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.75■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.75■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 G2E3Q7L622 706 aa22.74■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 TAF1P21675 1872 aa22.73■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.73■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 GPSM2P81274 684 aa22.73■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 FLIIQ13045 1269 aa22.73■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.73■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 POLLQ9UGP5 575 aa22.73■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.72■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.72■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.72■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 EYA3Q99504 573 aa22.72■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 LTBP1Q14766 1721 aa22.71■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 YDJCA8MPS7 323 aa22.71■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 C6orf229H3BNL8 230 aa22.71■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 H7C1W4 665 aa22.71■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.71■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.71■■□□□ 1.23
HDDC3-201ENST00000330334 RAD17O75943 681 aa22.7■■□□□ 1.22
HDDC3-201ENST00000330334 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
HDDC3-201ENST00000330334 CTSWP56202 376 aa22.7■■□□□ 1.22
HDDC3-201ENST00000330334 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
HDDC3-201ENST00000330334 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.7■■□□□ 1.22
HDDC3-201ENST00000330334 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.69■■□□□ 1.22
HDDC3-201ENST00000330334 DPF2Q92785 391 aa22.69■■□□□ 1.22
HDDC3-201ENST00000330334 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
HDDC3-201ENST00000330334 COL4A1P02462 1669 aa22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-201ENST00000330334 RTL9Q8NET4 1388 aa22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-201ENST00000330334 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-201ENST00000330334 GCKRQ14397 625 aa22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-201ENST00000330334 LINS1Q8NG48 757 aa22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-201ENST00000330334 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-201ENST00000330334 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-201ENST00000330334 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-201ENST00000330334 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-201ENST00000330334 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-201ENST00000330334 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.68■■□□□ 1.22
HDDC3-201ENST00000330334 CNTNAP1P78357 1384 aa22.67■■□□□ 1.22
HDDC3-201ENST00000330334 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.67■■□□□ 1.22
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