RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258083.2

PRADC1-201, Transcript of protease associated domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRADC1, Length 1,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1-201ENST00000258083 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
PRADC1-201ENST00000258083 TMC4Q7Z404 712 aa28.56■■■□□ 2.16
PRADC1-201ENST00000258083 VPS33BQ9H267 617 aa28.56■■■□□ 2.16
PRADC1-201ENST00000258083 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
PRADC1-201ENST00000258083 IGKV5-2P06315 115 aa28.55■■■□□ 2.16
PRADC1-201ENST00000258083 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
PRADC1-201ENST00000258083 SMC1BQ8NDV3 1235 aa28.55■■■□□ 2.16
PRADC1-201ENST00000258083 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
PRADC1-201ENST00000258083 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
PRADC1-201ENST00000258083 JDP2Q8WYK2 163 aa28.54■■■□□ 2.16
PRADC1-201ENST00000258083 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.54■■■□□ 2.16
PRADC1-201ENST00000258083 APLP1P51693 650 aa28.53■■■□□ 2.16
PRADC1-201ENST00000258083 FLIIQ13045 1269 aa28.52■■■□□ 2.16
PRADC1-201ENST00000258083 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
PRADC1-201ENST00000258083 LARGE2Q8N3Y3 721 aa28.51■■■□□ 2.15
PRADC1-201ENST00000258083 LRRC37AA6NMS7 1700 aa28.51■■■□□ 2.15
PRADC1-201ENST00000258083 CDHR2Q9BYE9 1310 aa28.5■■■□□ 2.15
PRADC1-201ENST00000258083 IQCA1LA6NCM1 817 aa28.5■■■□□ 2.15
PRADC1-201ENST00000258083 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
PRADC1-201ENST00000258083 GPC2Q8N158 579 aa28.5■■■□□ 2.15
PRADC1-201ENST00000258083 MPNDQ8N594 471 aa28.5■■■□□ 2.15
PRADC1-201ENST00000258083 SUPT20HQ8NEM7 779 aa28.5■■■□□ 2.15
PRADC1-201ENST00000258083 COL4A1P02462 1669 aa28.5■■■□□ 2.15
PRADC1-201ENST00000258083 TAF1P21675 1872 aa28.5■■■□□ 2.15
PRADC1-201ENST00000258083 NEXNQ0ZGT2 675 aa28.49■■■□□ 2.15
PRADC1-201ENST00000258083 CACNA1FO60840 1977 aa28.49■■■□□ 2.15
PRADC1-201ENST00000258083 SCN4AP35499 1836 aa28.48■■■□□ 2.15
PRADC1-201ENST00000258083 NEURL1BA8MQ27 555 aa28.48■■■□□ 2.15
PRADC1-201ENST00000258083 PPIP5K2O43314 1243 aa28.48■■■□□ 2.15
PRADC1-201ENST00000258083 PDE8AO60658 829 aa28.48■■■□□ 2.15
PRADC1-201ENST00000258083 DUOX1Q9NRD9 1551 aa28.48■■■□□ 2.15
PRADC1-201ENST00000258083 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
PRADC1-201ENST00000258083 CCER2I3L3R5 266 aa28.46■■■□□ 2.15
PRADC1-201ENST00000258083 EIF6P56537 245 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
PRADC1-201ENST00000258083 KIAA2012Q0VF49 1180 aa28.46■■■□□ 2.15
PRADC1-201ENST00000258083 AOC3Q16853 763 aa28.46■■■□□ 2.15
PRADC1-201ENST00000258083 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
PRADC1-201ENST00000258083 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
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PRADC1-201ENST00000258083 CCDC152Q4G0S7 254 aa28.45■■■□□ 2.14
PRADC1-201ENST00000258083 NIM1KQ8IY84 436 aa28.45■■■□□ 2.14
PRADC1-201ENST00000258083 DNAAF4Q8WXU2 420 aa28.45■■■□□ 2.14
PRADC1-201ENST00000258083 SEC31BQ9NQW1 1179 aa28.44■■■□□ 2.14
PRADC1-201ENST00000258083 H7C1W4 665 aa28.43■■■□□ 2.14
PRADC1-201ENST00000258083 POTEIP0CG38 1075 aa28.43■■■□□ 2.14
PRADC1-201ENST00000258083 POTEJP0CG39 1038 aa28.43■■■□□ 2.14
PRADC1-201ENST00000258083 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa28.43■■■□□ 2.14
PRADC1-201ENST00000258083 HACL1Q9UJ83 578 aa28.43■■■□□ 2.14
PRADC1-201ENST00000258083 GCKRQ14397 625 aa28.42■■■□□ 2.14
PRADC1-201ENST00000258083 LINS1Q8NG48 757 aa28.42■■■□□ 2.14
PRADC1-201ENST00000258083 ZNRF3Q9ULT6 936 aa28.42■■■□□ 2.14
PRADC1-201ENST00000258083 LTBP1Q14766 1721 aa28.41■■■□□ 2.14
PRADC1-201ENST00000258083 CTSWP56202 376 aa28.41■■■□□ 2.14
PRADC1-201ENST00000258083 CHADLQ6NUI6 762 aa28.41■■■□□ 2.14
PRADC1-201ENST00000258083 CASP7P55210 303 aa28.4■■■□□ 2.14
PRADC1-201ENST00000258083 LDHDQ86WU2 507 aa28.4■■■□□ 2.14
PRADC1-201ENST00000258083 RTL9Q8NET4 1388 aa28.39■■■□□ 2.14
PRADC1-201ENST00000258083 EPHX2P34913 555 aa28.39■■■□□ 2.14
PRADC1-201ENST00000258083 SCNN1DP51172 638 aa28.39■■■□□ 2.14
PRADC1-201ENST00000258083 GPSM2P81274 684 aa28.39■■■□□ 2.14
PRADC1-201ENST00000258083 TTLL11Q8NHH1 800 aa28.39■■■□□ 2.14
PRADC1-201ENST00000258083 PLA2G12BQ9BX93 195 aa28.39■■■□□ 2.14
PRADC1-201ENST00000258083 PODXL2Q9NZ53 605 aa28.39■■■□□ 2.14
PRADC1-201ENST00000258083 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
PRADC1-201ENST00000258083 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa28.38■■■□□ 2.13
PRADC1-201ENST00000258083 E9PSI1 815 aa28.38■■■□□ 2.13
PRADC1-201ENST00000258083 CXCL9Q07325 125 aa28.38■■■□□ 2.13
PRADC1-201ENST00000258083 POLLQ9UGP5 575 aa28.38■■■□□ 2.13
PRADC1-201ENST00000258083 GJA3Q9Y6H8 435 aa28.38■■■□□ 2.13
PRADC1-201ENST00000258083 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa28.37■■■□□ 2.13
PRADC1-201ENST00000258083 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
PRADC1-201ENST00000258083 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
PRADC1-201ENST00000258083 HTRA3P83110 453 aa28.35■■■□□ 2.13
PRADC1-201ENST00000258083 SLFN5Q08AF3 891 aa28.35■■■□□ 2.13
PRADC1-201ENST00000258083 WASHC4Q2M389 1173 aa28.35■■■□□ 2.13
PRADC1-201ENST00000258083 BEND3Q5T5X7 828 aa28.35■■■□□ 2.13
PRADC1-201ENST00000258083 TBC1D16Q8TBP0 767 aa28.35■■■□□ 2.13
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PRADC1-201ENST00000258083 F6X3S4 739 aa28.34■■■□□ 2.13
PRADC1-201ENST00000258083 GREM2Q9H772 168 aa28.34■■■□□ 2.13
PRADC1-201ENST00000258083 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa28.33■■■□□ 2.13
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PRADC1-201ENST00000258083 PASKQ96RG2 1323 aa28.32■■■□□ 2.12
PRADC1-201ENST00000258083 MYH3P11055 1940 aa28.31■■■□□ 2.12
PRADC1-201ENST00000258083 CSF1RP07333 972 aa28.31■■■□□ 2.12
PRADC1-201ENST00000258083 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
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PRADC1-201ENST00000258083 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
PRADC1-201ENST00000258083 EYA3Q99504 573 aa28.31■■■□□ 2.12
PRADC1-201ENST00000258083 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
PRADC1-201ENST00000258083 KLRG1Q96E93 195 aa28.3■■■□□ 2.12
PRADC1-201ENST00000258083 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
PRADC1-201ENST00000258083 GPRC5DQ9NZD1 345 aa28.3■■■□□ 2.12
PRADC1-201ENST00000258083 PCNTO95613 3336 aa28.3■■■□□ 2.12
PRADC1-201ENST00000258083 TNIP1Q15025 636 aa28.29■■■□□ 2.12
PRADC1-201ENST00000258083 XDHP47989 1333 aa28.28■■■□□ 2.12
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