RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251722.10

USP40-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene USP40, Length 5,692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-201ENST00000251722 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
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USP40-201ENST00000251722 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
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USP40-201ENST00000251722 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.65□□□□□ -0.06
USP40-201ENST00000251722 OGFRQ9NZT2 677 aa14.65□□□□□ -0.06
USP40-201ENST00000251722 WTAPQ15007 396 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-201ENST00000251722 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-201ENST00000251722 RNMTO43148 476 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP40-201ENST00000251722 KIF4AO95239 1232 aa14.64□□□□□ -0.07
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