RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.86■■□□□ 1.89
CITED1-201ENST00000246139 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.86■■□□□ 1.89
CITED1-201ENST00000246139 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.85■■□□□ 1.89
CITED1-201ENST00000246139 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
CITED1-201ENST00000246139 GRAPQ13588 217 aa26.85■■□□□ 1.89
CITED1-201ENST00000246139 LDHDQ86WU2 507 aa26.85■■□□□ 1.89
CITED1-201ENST00000246139 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CITED1-201ENST00000246139 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CITED1-201ENST00000246139 FZD9O00144 591 aa26.84■■□□□ 1.89
CITED1-201ENST00000246139 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CITED1-201ENST00000246139 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CITED1-201ENST00000246139 SLC4A2P04920 1241 aa26.84■■□□□ 1.89
CITED1-201ENST00000246139 SP8Q8IXZ3 490 aa26.84■■□□□ 1.89
CITED1-201ENST00000246139 TNS4Q8IZW8 715 aa26.84■■□□□ 1.89
CITED1-201ENST00000246139 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CITED1-201ENST00000246139 CAPN15O75808 1086 aa26.83■■□□□ 1.89
CITED1-201ENST00000246139 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
CITED1-201ENST00000246139 KSR2Q6VAB6 950 aa26.83■■□□□ 1.89
CITED1-201ENST00000246139 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.83■■□□□ 1.89
CITED1-201ENST00000246139 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.83■■□□□ 1.89
CITED1-201ENST00000246139 PPIP5K2O43314 1243 aa26.82■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 VAMP4O75379 141 aa26.82■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 HACL1Q9UJ83 578 aa26.82■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.81■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 G2E3Q7L622 706 aa26.81■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 NIM1KQ8IY84 436 aa26.81■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 MPNDQ8N594 471 aa26.81■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.81■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.81■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.81■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.81■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 EPHX2P34913 555 aa26.8■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 AOC3Q16853 763 aa26.79■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 GPC2Q8N158 579 aa26.79■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 TMC4Q7Z404 712 aa26.78■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 CNTNAP1P78357 1384 aa26.78■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 LTBP1Q14766 1721 aa26.78■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 LAMB2P55268 1798 aa26.78■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 VPS33BQ9H267 617 aa26.77■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.77■■□□□ 1.88
CITED1-201ENST00000246139 ZNF521Q96K83 1311 aa26.76■■□□□ 1.87
CITED1-201ENST00000246139 CCER2I3L3R5 266 aa26.76■■□□□ 1.87
CITED1-201ENST00000246139 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.76■■□□□ 1.87
CITED1-201ENST00000246139 FLIIQ13045 1269 aa26.76■■□□□ 1.87
CITED1-201ENST00000246139 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
CITED1-201ENST00000246139 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
CITED1-201ENST00000246139 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CITED1-201ENST00000246139 TMEM88BA6NKF7 163 aa26.74■■□□□ 1.87
CITED1-201ENST00000246139 IGKV5-2P06315 115 aa26.74■■□□□ 1.87
CITED1-201ENST00000246139 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
CITED1-201ENST00000246139 VEGFBP49765 207 aa26.73■■□□□ 1.87
CITED1-201ENST00000246139 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
CITED1-201ENST00000246139 CNTROBQ8N137 903 aa26.73■■□□□ 1.87
CITED1-201ENST00000246139 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.73■■□□□ 1.87
CITED1-201ENST00000246139 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CITED1-201ENST00000246139 FOXN1O15353 648 aa26.72■■□□□ 1.87
CITED1-201ENST00000246139 PDE8AO60658 829 aa26.72■■□□□ 1.87
CITED1-201ENST00000246139 RPS8P62241 208 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
CITED1-201ENST00000246139 CCDC152Q4G0S7 254 aa26.72■■□□□ 1.87
CITED1-201ENST00000246139 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CITED1-201ENST00000246139 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CITED1-201ENST00000246139 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
CITED1-201ENST00000246139 EPS15P42566 896 aa26.7■■□□□ 1.86
CITED1-201ENST00000246139 SCNN1DP51172 638 aa26.7■■□□□ 1.86
CITED1-201ENST00000246139 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.86
CITED1-201ENST00000246139 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.7■■□□□ 1.86
CITED1-201ENST00000246139 SEC31BQ9NQW1 1179 aa26.7■■□□□ 1.86
CITED1-201ENST00000246139 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.69■■□□□ 1.86
CITED1-201ENST00000246139 C6orf229H3BNL8 230 aa26.69■■□□□ 1.86
CITED1-201ENST00000246139 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.69■■□□□ 1.86
CITED1-201ENST00000246139 CDHR2Q9BYE9 1310 aa26.68■■□□□ 1.86
CITED1-201ENST00000246139 GPSM2P81274 684 aa26.68■■□□□ 1.86
CITED1-201ENST00000246139 CXCL9Q07325 125 aa26.68■■□□□ 1.86
CITED1-201ENST00000246139 TAF1P21675 1872 aa26.68■■□□□ 1.86
CITED1-201ENST00000246139 WASHC4Q2M389 1173 aa26.67■■□□□ 1.86
CITED1-201ENST00000246139 E9PSI1 815 aa26.66■■□□□ 1.86
CITED1-201ENST00000246139 RIMBP2O15034 1052 aa26.66■■□□□ 1.86
CITED1-201ENST00000246139 RAD17O75943 681 aa26.65■■□□□ 1.86
CITED1-201ENST00000246139 CIAPIN1Q6FI81 312 aa26.65■■□□□ 1.86
CITED1-201ENST00000246139 LINS1Q8NG48 757 aa26.65■■□□□ 1.86
CITED1-201ENST00000246139 RASSF10A6NK89 507 aa26.64■■□□□ 1.86
CITED1-201ENST00000246139 H7C1W4 665 aa26.64■■□□□ 1.86
CITED1-201ENST00000246139 GCKRQ14397 625 aa26.64■■□□□ 1.86
CITED1-201ENST00000246139 TNIP1Q15025 636 aa26.64■■□□□ 1.86
CITED1-201ENST00000246139 EYA3Q99504 573 aa26.64■■□□□ 1.86
CITED1-201ENST00000246139 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa26.64■■□□□ 1.86
CITED1-201ENST00000246139 POLLQ9UGP5 575 aa26.64■■□□□ 1.86
CITED1-201ENST00000246139 CTSWP56202 376 aa26.63■■□□□ 1.85
CITED1-201ENST00000246139 SLFN5Q08AF3 891 aa26.63■■□□□ 1.85
CITED1-201ENST00000246139 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.63■■□□□ 1.85
CITED1-201ENST00000246139 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67 ms