RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 MED17Q9NVC6 651 aa16.44■□□□□ 0.22
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PTX4-201ENST00000293922 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa16.43■□□□□ 0.22
PTX4-201ENST00000293922 CHP2O43745 196 aa16.43■□□□□ 0.22
PTX4-201ENST00000293922 GADD45GO95257 159 aa16.43■□□□□ 0.22
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PTX4-201ENST00000293922 OSGIN1Q9UJX0 560 aa16.4■□□□□ 0.22
PTX4-201ENST00000293922 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
PTX4-201ENST00000293922 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
PTX4-201ENST00000293922 RBM34P42696 430 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
PTX4-201ENST00000293922 PODNL1Q6PEZ8 512 aa16.39■□□□□ 0.21
PTX4-201ENST00000293922 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
PTX4-201ENST00000293922 SVOPLQ8N434 492 aa16.39■□□□□ 0.21
PTX4-201ENST00000293922 ICA1LQ8NDH6 482 aa16.39■□□□□ 0.21
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