RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP11.23□□□□□ -0.61
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PRAME-212ENST00000485532 RMND5AQ9H871 391 aa11.23□□□□□ -0.61
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PRAME-212ENST00000485532 GLRX2Q9NS18 164 aa11.23□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 SLC6A13Q9NSD5 602 aa11.23□□□□□ -0.61
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PRAME-212ENST00000485532 PDZK1Q5T2W1 519 aa11.21□□□□□ -0.61
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PRAME-212ENST00000485532 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa11.21□□□□□ -0.61
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PRAME-212ENST00000485532 ZNF527Q8NB42 609 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 OR56A1Q8NGH5 318 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 ZFP90Q8TF47 636 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 LRRC58Q96CX6 371 aa11.21□□□□□ -0.61
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PRAME-212ENST00000485532 SDF2Q99470 211 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 CGREF1Q99674 301 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
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PRAME-212ENST00000485532 HHATLQ9HCP6 504 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 GID8Q9NWU2 228 aa11.21□□□□□ -0.61
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PRAME-212ENST00000485532 PRSS50Q9UI38 385 aa11.21□□□□□ -0.61
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PRAME-212ENST00000485532 DTNAQ9Y4J8 743 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa11.21□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
PRAME-212ENST00000485532 CADP27708 2225 aa11.21□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 HIVEP2P31629 2446 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 CR1P17927 2039 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 ZNF814B7Z6K7 855 aa11.2□□□□□ -0.62
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PRAME-212ENST00000485532 CYP7B1O75881 506 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 PRKD3O94806 890 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 H6PDO95479 791 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 NPPAP01160 153 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 C1QCP02747 245 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 YES1P07947 543 aa11.2□□□□□ -0.62
PRAME-212ENST00000485532 SOD3P08294 240 aa11.2□□□□□ -0.62
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