RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430853.5

TTC28-AS1-211, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 564 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-211ENST00000430853 GDF7Q7Z4P5 450 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MEIOBQ8N635 442 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 OR5M1Q8NGP8 315 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 STK35Q8TDR2 534 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CANT1Q8WVQ1 401 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SLC41A3Q96GZ6 507 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 HS6ST2Q96MM7 605 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TIMP4Q99727 224 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 NPAS1Q99742 590 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PIP5K1AQ99755 562 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TMEM43Q9BTV4 400 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PRR14Q9BWN1 585 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 POTEKPQ9BYX7 375 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SLC19A3Q9BZV2 496 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PRDM14Q9GZV8 571 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SPRR3Q9UBC9 169 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SLC7A7Q9UM01 511 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 AURKCQ9UQB9 309 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ZNF835Q9Y2P0 537 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SHANK1Q9Y566 2161 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 GTF3C1Q12789 2109 aa11.86□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CFAP46Q8IYW2 2715 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 A0A1W2PRQ8 180 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 AHRRA9YTQ3 701 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SHISA8B8ZZ34 492 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 H3BML4 177 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 hCG_2039718K7EN88 272 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ADAMDEC1O15204 470 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 EFNA2O43921 213 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SEMA7AO75326 666 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PRSS23O95084 383 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PTGER4P35408 488 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 DGCR6Q14129 220 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TRAM2Q15035 370 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SYT14P1Q58G82 188 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ZFP1Q6P2D0 407 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PIK3C3Q8NEB9 887 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 DHRS1Q96LJ7 313 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 KLHL15Q96M94 604 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 EPYCQ99645 322 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ZNF426Q9BUY5 554 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CHID1Q9BWS9 393 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TIGARQ9NQ88 270 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ARMC1Q9NVT9 282 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TRAPPC4Q9Y296 219 aa11.85□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 BSNQ9UPA5 3926 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TMEM72A0PK05 275 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 NPIPA2E9PIF3 369 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 NPIPA3F8WFD2 350 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PRRG2O14669 202 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FFAR1O14842 300 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 OR2T1O43869 369 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 NPIPB7O75200 414 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FKBP6O75344 327 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 C1QL1O75973 258 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 LYPD3O95274 346 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 IGF2P01344 180 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 H1F0P07305 194 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FCGR1AP12314 374 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 GABRA1P14867 456 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ABOP16442 354 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 HMGA2P52926 109 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CLDN18P56856 261 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 POMZP3Q6PJE2 187 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 GGNQ86UU5 652 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 GALNT11Q8NCW6 608 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 OR6S1Q8NH40 331 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FAM57AQ8TBR7 257 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 RNF217Q8TC41 542 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ZPLD1Q8TCW7 415 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MIB2Q96AX9 1013 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 WDYHV1Q96HA8 205 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 AP4S1Q9Y587 144 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SVILO95425 2214 aa11.84□□□□□ -0.51
TTC28-AS1-211ENST00000430853 J3KTA2 159 aa11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-211ENST00000430853 DNPH1O43598 174 aa11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-211ENST00000430853 WDR1O75083 606 aa11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-211ENST00000430853 WISP2O76076 250 aa11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-211ENST00000430853 WISP1O95388 367 aa11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PMS2P2O95744 297 aa11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-211ENST00000430853 THY1P04216 161 aa11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TFPIP10646 304 aa11.83□□□□□ -0.52
TTC28-AS1-211ENST00000430853 IL11P20809 199 aa11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms