RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625891.2

NRXN1-223, Transcript of neurexin 1, human

TSL 4 BASIC

Gene NRXN1, Length 1,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NRXN1-223	ENST00000625891	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	TRIP10	Q15642	601 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	HKDC1	Q2TB90	917 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	WLS	Q5T9L3	541 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	TPGS2	Q68CL5	300 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	CBLN3	Q6UW01	205 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	PSMG2	Q969U7	264 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	TTC25	Q96NG3	672 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	MED20	Q9H944	212 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	GCNT4	Q9P109	453 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	PTPRB	P23467	1997 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	CLDN5	O00501	218 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	CYB561D2	O14569	222 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	ZNF195	O14628	629 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	HPR	P00739	348 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	PIGR	P01833	764 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	CLTA	P09496	248 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	UQCRB	P14927	111 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	RPA2	P15927	270 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	ATP6V1C1	P21283	382 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	PTPN4	P29074	926 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	TRIM23	P36406	574 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	ACADVL	P49748	655 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	SGSH	P51688	502 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	DHODH	Q02127	395 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	RUNX3	Q13761	415 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	ZNF77	Q15935	545 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891		Q6ZRP5	223 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	ART5	Q96L15	291 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	CCT7	Q99832	543 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	STARD5	Q9NSY2	213 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	FZR1	Q9UM11	496 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	RNF6	Q9Y252	685 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	FKBP7	Q9Y680	259 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	NUMA1	Q14980	2115 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891		K7EQM0	130 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	SGK1	O00141	431 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	TRAPPC3	O43617	180 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	NXPH2	O95156	264 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	SNX4	O95219	450 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	FH	P07954	510 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	ZNF806	P0C7X5	589 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	CLU	P10909	449 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	PTGER3	P43115	390 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	CLDN6	P56747	220 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	CBX1	P83916	185 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	NAAA	Q02083	359 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NRXN1-223	ENST00000625891	SLC17A1	Q14916	467 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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