RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP5J2P56134 94 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CASP8Q14790 479 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DPY19L1Q2PZI1 675 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYT14P1Q58G82 188 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPANXN4Q5MJ08 99 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMPPEQ6ZT21 453 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC34Q8IZ02 419 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM71CQ8NEG0 241 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEURL3Q96EH8 262 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CENPHQ9H3R5 247 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HAO1Q9UJM8 370 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF724A8MTY0 619 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SULT2B1O00204 365 aa23.2■■□□□ 1.3
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF563Q8TA94 476 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SAP130Q9H0E3 1048 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNK9Q9NPC2 374 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 E9PBE3 544 aa23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LYZL6O75951 148 aa23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TFPIP10646 304 aa23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 S100A3P33764 101 aa23.19■■□□□ 1.3
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPAT3Q53EU6 434 aa23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AP1ARQ63HQ0 302 aa23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FRRS1Q6ZNA5 592 aa23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GALNT5Q7Z7M9 940 aa23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF100Q8IYN0 542 aa23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC35A5Q9BS91 424 aa23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PARD6BQ9BYG5 372 aa23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MEAF6Q9HAF1 191 aa23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTPS2Q9NRF8 586 aa23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PNPOQ9NVS9 261 aa23.19■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EDNRAP25101 427 aa23.18■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RYKP34925 604 aa23.18■■□□□ 1.3
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STK11Q15831 433 aa23.18■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZG16BQ96DA0 208 aa23.18■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC106Q9BWC9 280 aa23.18■■□□□ 1.3
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EMC3Q9P0I2 261 aa23.18■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHRNA9Q9UGM1 479 aa23.18■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BSPH1Q075Z2 132 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEP85LQ5SZL2 805 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRINAQ7Z429 371 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HMGN2P46Q86SG4 172 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEUROG1Q92886 237 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC115Q96NT0 180 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BTNL2Q9UIR0 455 aa23.17■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NME5P56597 212 aa23.16■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNJ10P78508 379 aa23.16■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHRNEQ04844 493 aa23.16■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BST1Q10588 318 aa23.16■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDK3Q15120 406 aa23.16■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPA1Q15181 289 aa23.16■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa23.16■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OGFOD2Q6N063 350 aa23.16■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MUCL1Q96DR8 90 aa23.16■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TEX37Q96LM6 180 aa23.16■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DPRXA6NFQ7 191 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OVOL3O00110 214 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HMGN4O00479 90 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOD3P08294 240 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DANCRP0C864 163 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GGT1P19440 569 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COX5AP20674 150 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV1-2P23083 117 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCSK6P29122 969 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UFM1P61960 85 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SSX8Q7RTT4 187 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF130Q86XS8 419 aa23.15■■□□□ 1.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIML2Q8N7C3 387 aa23.15■■□□□ 1.3
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