RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-211ENST00000467464 NUDCD3Q8IVD9 361 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRF-211ENST00000467464 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
PTPRF-211ENST00000467464 CLECL1Q8IZS7 167 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRF-211ENST00000467464 NATD1Q8N6N6 113 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRF-211ENST00000467464 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
PTPRF-211ENST00000467464 OR5D16Q8NGK9 328 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRF-211ENST00000467464 OR6K3Q8NGY3 331 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRF-211ENST00000467464 OR5AK3PQ8NH89 298 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRF-211ENST00000467464 TUBGCP3Q96CW5 907 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRF-211ENST00000467464 ZIM3Q96PE6 472 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRF-211ENST00000467464 HS3ST6Q96QI5 342 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRF-211ENST00000467464 DUSP26Q9BV47 211 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRF-211ENST00000467464 PARD6BQ9BYG5 372 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRF-211ENST00000467464 TMEM185BQ9H7F4 350 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRF-211ENST00000467464 NEUROD4Q9HD90 331 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRF-211ENST00000467464 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
PTPRF-211ENST00000467464 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRF-211ENST00000467464 ATAD3AQ9NVI7 634 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRF-211ENST00000467464 ELOVL5Q9NYP7 299 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRF-211ENST00000467464 NDRG3Q9UGV2 375 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRF-211ENST00000467464 KCNE5Q9UJ90 142 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRF-211ENST00000467464 CLEC4AQ9UMR7 237 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRF-211ENST00000467464 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 ITPR3Q14573 2671 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 TNFSF11O14788 317 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 BIRC5O15392 142 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 THBDP07204 575 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 POU2F1P14859 743 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 ELK4P28324 431 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 ATP12AP54707 1039 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 RPS26P62854 115 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 KEAP1Q14145 624 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 CHI3L2Q15782 390 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 KRT71Q3SY84 523 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 FBXW10Q5XX13 1052 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 OR4F3Q6IEY1 312 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 CLEC4FQ8N1N0 589 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 WFDC11Q8NEX6 87 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 GPR119Q8TDV5 335 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 MOAP1Q96BY2 351 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 KLHL15Q96M94 604 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 OR7D2Q96RA2 312 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 SDF2Q99470 211 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 SRXN1Q9BYN0 137 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 COQ10BQ9H8M1 238 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 AKTIPQ9H8T0 292 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 RAB21Q9UL25 225 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 PROCRQ9UNN8 238 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 CARD8Q9Y2G2 431 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 MTORP42345 2549 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 WDR91A4D1P6 747 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 C16orf97H3BN30 126 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 DNAJA2O60884 412 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 KRT16P08779 473 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 HPGDP15428 266 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 AGTR1P30556 359 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 P2RX1P51575 399 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 FUT5Q11128 374 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 SGCBQ16585 318 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 SLC25A53Q5H9E4 307 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 AP1ARQ63HQ0 302 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 STAC2Q6ZMT1 411 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 OLIG3Q7RTU3 272 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 LILRA2Q8N149 483 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF527Q8NB42 609 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 OR8J2Q8NGG1 315 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 FBXO27Q8NI29 283 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 MIPOL1Q8TD10 442 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 ADAMTS15Q8TE58 950 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 RNF128Q8TEB7 428 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 OSTF1Q92882 214 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 CHMP6Q96FZ7 201 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 PPP1R36Q96LQ0 422 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 SLC39A3Q9BRY0 314 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 MED18Q9BUE0 208 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 HOXD1Q9GZZ0 328 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 EDARQ9UNE0 448 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 RAP2CQ9Y3L5 183 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF195O14628 629 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 CASKO14936 926 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 TM9SF1O15321 606 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRF-211ENST00000467464 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms