RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544361.1

QKI-213, Transcript of QKI, KH domain containing RNA binding, human

TSL 5

Gene QKI, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QKI-213	ENST00000544361		A0A1W2PRG6	482 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	C5orf51	A6NDU8	294 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	MSGN1	A6NI15	193 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	MEI4	A8MW99	385 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361		M0R3G1	203 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	RAD51B	O15315	384 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ZW10	O43264	779 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	OR10H2	O60403	315 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	NMT2	O60551	498 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	UGT1A9	O60656	530 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ZNF254	O75437	659 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	DFFB	O76075	338 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SNX4	O95219	450 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PTTG1	O95997	202 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	GSR	P00390	522 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SHBG	P04278	402 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	POLR2M	P0CAP2	368 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	STAG3L1	P0CL83	205 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SMIM18	P0DKX4	95 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	RALB	P11234	206 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	UGT1A6	P19224	532 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	UGT1A4	P22310	534 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CTNNA2	P26232	953 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	DCK	P27707	260 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	UGT1A3	P35503	534 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	UGT1A5	P35504	534 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	MMP12	P39900	470 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	AP3M2	P53677	418 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	UCP2	P55851	309 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	HERV-K104	P61576	105 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	COPZ1	P61923	177 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	HTD2	P86397	168 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	MYBPC1	Q00872	1141 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ZNF45	Q02386	682 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	3.34	□□□□□ -1.87	1e-8	■■■■■ 33.4
QKI-213	ENST00000544361	TRADD	Q15628	312 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	DUSP7	Q16829	419 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	KLHL12	Q53G59	568 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	HOGA1	Q86XE5	327 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CDK20	Q8IZL9	346 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	METTL13	Q8N6R0	699 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	AMER3	Q8N944	861 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	C10orf82	Q8WW14	230 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SGK3	Q96BR1	496 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	LRRC39	Q96DD0	335 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	MS4A14	Q96JA4	679 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SPATA13	Q96N96	652 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PANX3	Q96QZ0	392 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	RAD9A	Q99638	391 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	DOK1	Q99704	481 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CIB1	Q99828	191 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	TMEM245	Q9H330	911 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		3.34	□□□□□ -1.87

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