RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544361.1

QKI-213, Transcript of QKI, KH domain containing RNA binding, human

TSL 5

Gene QKI, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QKI-213	ENST00000544361	SERINC4	A6NH21	518 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	FLRT2	O43155	660 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	AQP9	O43315	295 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PI15	O43692	258 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SCO2	O43819	266 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CLPX	O76031	633 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	GLCE	O94923	617 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CCNE2	O96020	404 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	IFNA14	P01570	189 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	IGHV2-70	P01814	119 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	C9	P02748	559 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	YES1	P07947	543 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PRKACA	P17612	351 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	AOC1	P19801	751 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	RPA1	P27694	616 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	NAMPT	P43490	491 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	RABIF	P47224	123 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ALDH3B2	P48448	385 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CSRP3	P50461	194 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	GMFB	P60983	142 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	RAB14	P61106	215 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	HAND2	P61296	217 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	GALK2	Q01415	458 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	KLRC3	Q07444	240 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	VEZF1	Q14119	521 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	OXA1L	Q15070	435 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	TAB1	Q15750	504 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	C2CD6	Q53TS8	623 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	LRRC38	Q5VT99	294 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CENPP	Q6IPU0	288 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ARC	Q7LC44	396 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	STX19	Q8N4C7	294 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PROX1	Q92786	737 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	OMA1	Q96E52	524 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ARL5B	Q96KC2	179 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CEP170P1	Q96L14	293 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ZNF560	Q96MR9	790 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	RILP	Q96NA2	401 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	TSGA13	Q96PP4	275 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CYTH2	Q99418	400 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	THTPA	Q9BU02	230 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	NAPB	Q9H115	298 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	TRABD	Q9H4I3	376 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	LRRC19	Q9H756	370 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	INIP	Q9NRY2	104 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	FGF21	Q9NSA1	209 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ZNF221	Q9UK13	617 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PSME2	Q9UL46	239 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CFL2	Q9Y281	166 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	RREB1	Q92766	1687 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	NUP98	P52948	1817 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ATRN	O75882	1429 aa		3.35	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	LRP5	O75197	1615 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361		A0A0G2JND7	137 aa		3.34	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		3.34	□□□□□ -1.87

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