RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MTMR9Q96QG7 549 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM173AQ9BQD7 235 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BPIFA3Q9BQP9 254 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLEC7AQ9BXN2 247 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PARD6BQ9BYG5 372 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANKRA2Q9H9E1 313 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 THEGQ9P2T0 379 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF221Q9UK13 617 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FBXO7Q9Y3I1 522 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GMPPBQ9Y5P6 360 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GRIN2DO15399 1336 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM172BPA6NC97 362 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR6C65A6NJZ3 312 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PMS2P5A8MQ11 134 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF212BA8MTL3 300 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCDH7O60245 1069 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DIRAS1O95057 198 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NXPH4O95158 308 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BMP15O95972 392 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRT14P02533 472 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGKV2-30P06310 120 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 H2BFMP0C1H6 154 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR8G3PP0DMU2 310 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RALBP11234 206 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRKACGP22612 351 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GNPDA1P46926 289 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EFNB2P52799 333 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GSTO1P78417 241 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC5A12Q1EHB4 618 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HLA-BQ31612 363 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ALKBH6Q3KRA9 238 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 XKR7Q5GH72 579 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ACER2Q5QJU3 275 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LCLAT1Q6UWP7 414 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OTUD6AQ7L8S5 288 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC50Q8IVM0 306 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPR137CQ8N3F9 429 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FGFRL1Q8N441 504 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SDR9C7Q8NEX9 313 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANKRD49Q8WVL7 239 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MCUR1Q96AQ8 359 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TIMD4Q96H15 378 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CENPKQ9BS16 269 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIM62Q9BVG3 475 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DUSP16Q9BY84 665 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HIPK2Q9H2X6 1198 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM185BQ9H7F4 350 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DEPPQ9NTK1 212 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KLHL28Q9NXS3 571 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GCNT4Q9P109 453 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GALPQ9UBC7 116 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC7A8Q9UHI5 535 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CA5BQ9Y2D0 317 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FRMPD4Q14CM0 1322 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PNPLA6Q8IY17 1366 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPIAL4EA0A075B759 164 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ACOD1A6NK06 481 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HAS3O00219 553 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TAPBPO15533 448 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARHGEF9O43307 516 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNAB3O43448 404 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FCGR3AP08637 254 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 POLR2MP0CAP2 368 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPIAL4FP0DN26 164 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BCKDHAP12694 445 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IMPDH1P20839 514 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHRNB4P30926 498 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SSR1P43307 286 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MAGEA1P43355 309 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPS15P62841 145 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF33BQ06732 778 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PEX6Q13608 980 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UPP1Q16831 310 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC25A52Q3SY17 297 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF585BQ52M93 769 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MUC21Q5SSG8 566 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAET1LQ5VY80 246 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR8G2PQ6IF36 304 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM107Q6UX40 140 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FRRS1Q6ZNA5 592 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RFLNBQ8N5W9 214 aa4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms