RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 CCDC32Q9BV29 185 aa16.02■□□□□ 0.16
NISCH-213ENST00000489895 HDHD5Q9BXW7 423 aa16.02■□□□□ 0.16
NISCH-213ENST00000489895 OR10A4Q9H209 315 aa16.02■□□□□ 0.16
NISCH-213ENST00000489895 TAS2R8Q9NYW2 309 aa16.02■□□□□ 0.16
NISCH-213ENST00000489895 ERP29P30040 261 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 VASPP50552 380 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 WNT4P56705 351 aa16.02■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 RACK1P63244 317 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 REEP5Q00765 189 aa16.02■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 OR8S1Q8NH09 359 aa16.02■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa16.02■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 CNIH4Q9P003 139 aa16.02■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 CA5BQ9Y2D0 317 aa16.02■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 CITO14578 2027 aa16.02■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 GNAO1P09471 354 aa16.02■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 MECP2P51608 486 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 KIAA1024LP59773 190 aa16.02■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 SRYQ05066 204 aa16.02■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 PRR22Q8IZ63 422 aa16.02■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 CDH20Q9HBT6 801 aa16.02■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 GPR52Q9Y2T5 361 aa16.02■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 PCDH17O14917 1159 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 AIFM1O95831 613 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 IRF2P14316 349 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 TSFMP43897 325 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 ARG2P78540 354 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 NLGN4XQ8N0W4 816 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 EID2Q8N6I1 236 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 MRI1Q9BV20 369 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 LTBP4Q8N2S1 1624 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 ARAFP10398 606 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 CEBPGP53567 150 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 SHHQ15465 462 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 TDHQ8IZJ6 230 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 BPIFA2Q96DR5 249 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 ADOQ96SZ5 270 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 MAP3K3Q99759 626 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 C1GALT1Q9NS00 363 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 MAOBP27338 520 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 LCN1P31025 176 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 SFTPDP35247 375 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 MANEAQ5SRI9 462 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 KCTD9Q7L273 389 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 ISL2Q96A47 359 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 A0A1W2PPK0 400 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 RFXAPO00287 272 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 ITGAMP11215 1152 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 CD27P26842 260 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 MAGEA2P43356 314 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 SSX6Q7RTT6 188 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 IQCF1Q8N6M8 205 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 EGLN2Q96KS0 407 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 INIPQ9NRY2 104 aa16.01■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 OR7A17O14581 309 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 DIRAS3O95661 229 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 IRS1P35568 1242 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 AFMIDQ63HM1 303 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 LAS2Q8IYD9 372 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 OR51Q1Q8NH59 317 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 ZNF337Q9Y3M9 751 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 H3BML4 177 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 FXYD6P3P58550 94 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 CXCR4P61073 352 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 GPR139Q6DWJ6 353 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 TRIM46Q7Z4K8 759 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 ZNF597Q96LX8 424 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 C12orf71A8MTZ7 269 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 HBA1P69905 142 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 DCAF12Q5T6F0 453 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 GARNL3Q5VVW2 1013 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 VDAC3Q9Y277 283 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 SYT7O43581 403 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 DNAJB6O75190 326 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 SCRG1O75711 98 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 IDUAP35475 653 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 RAB40BQ12829 278 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 DNASE1L3Q13609 305 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 GALNT6Q8NCL4 622 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 CASTOR1Q8WTX7 329 aa16■□□□□ 0.15
NISCH-213ENST00000489895 ACAD8Q9UKU7 415 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms