RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373779.7

PTPRU-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-202ENST00000373779 GDI2P50395 445 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 CDK3Q00526 305 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 FIGLAQ6QHK4 219 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF584Q8IVC4 421 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 FBXL3Q9UKT7 428 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SCN9AQ15858 1988 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 OR52A4PA6NMU1 304 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 RPS19P39019 145 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 FAM71E1Q6IPT2 247 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 OR5J2Q8NH18 312 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 RAD9AQ99638 391 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 BTBD2Q9BX70 525 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SERINC1Q9NRX5 453 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 TAS2R8Q9NYW2 309 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 WASHC1A8K0Z3 465 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 CD3GP09693 182 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SLC6A12P48065 614 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF740Q8NDX6 193 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SEC61A2Q9H9S3 476 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa16.37■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 NAP1L6A6NFF2 107 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 PRAF2O60831 178 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF852Q6ZMS4 543 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 AVL9Q8NBF6 648 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 BPIFA2Q96DR5 249 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 TMEM185BQ9H7F4 350 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 VNN3Q9NY84 501 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 WRBO00258 174 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SLC19A1P41440 591 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 KCNJ5P48544 419 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 MAPK14Q16539 360 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF440Q8IYI8 595 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 OR5AK2Q8NH90 309 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 GAL3ST3Q96A11 431 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 HCRTR2O43614 444 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 RNH1P13489 461 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 GIFP27352 417 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 S100A10P60903 97 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 GRK1Q15835 563 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 IL20RBQ6UXL0 311 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 WASH2PQ6VEQ5 465 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 BHLHA9Q7RTU4 235 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 GALNT6Q8NCL4 622 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SLC17A9Q9BYT1 436 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 PIPP12273 146 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 APEX1P27695 318 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 CTF1Q16619 201 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 FAM69AQ5T7M9 428 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 RIT1Q92963 219 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF726A6NNF4 738 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 CLEC2LP0C7M8 214 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 ARHGDIBP52566 201 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 NKG7Q16617 165 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 ACER3Q9NUN7 267 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 MED17Q9NVC6 651 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 CDK10Q15131 360 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 ABCA11PQ4W5N1 156 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 XAF1Q6GPH4 301 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 PDZD9Q8IXQ8 264 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 OR52E1Q8NGJ3 308 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 OR5K2Q8NHB8 316 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 TCEAL4Q96EI5 215 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 ELMOD3Q96FG2 381 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF878C9JN71 531 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 DDOSTP39656 456 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 PSPHP78330 225 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 SDR9C7Q8NEX9 313 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF350Q9GZX5 532 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 NPIPA7E9PJI5 369 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 GFYI3L273 518 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 NPIPA8P0DM63 369 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 TEKQ02763 1124 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 CDC20Q12834 499 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRU-202ENST00000373779 DCST2Q5T1A1 773 aa16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.5 ms