RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592701.2

EFTUD2-224, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-224	ENST00000592701	POTEA	Q6S8J7	498 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	NLRP10	Q86W26	655 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	BCL11A	Q9H165	835 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	NUP98	P52948	1817 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	FAM161A	Q3B820	660 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	AK7	Q96M32	723 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	C4B	P0C0L5	1744 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	PARP10	Q53GL7	1025 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EFTUD2-224	ENST00000592701	RGL2	O15211	777 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	FOXO4	P98177	505 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24	3e-10	■■■□□ 16.5
EFTUD2-224	ENST00000592701	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	FAM89A	Q96GI7	184 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	BACH2	Q9BYV9	841 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	ZPR1	O75312	459 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	NARF	Q9UHQ1	456 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	SCN7A	Q01118	1682 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	APBA3	O96018	575 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	COPRS	Q9NQ92	184 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	PLSCR1	O15162	318 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	PHF14	O94880	888 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	ADRA2B	P18089	450 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	TXNRD1	Q16881	649 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	C8orf34	Q49A92	452 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	SUSD4	Q5VX71	490 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	SIL1	Q9H173	461 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	FAM177B	A6PVY3	158 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	PDE8A	O60658	829 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	RFC4	P35249	363 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	SMIM5	Q71RC9	77 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	MX1	P20591	662 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	CTSW	P56202	376 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	TTC22	Q5TAA0	569 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
EFTUD2-224	ENST00000592701	NTSR2	O95665	410 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	CSF1R	P07333	972 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	SSFA2	P28290	1259 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	PDE1A	P54750	535 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	SYNE4	Q8N205	404 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	C4A	P0C0L4	1744 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	AOX1	Q06278	1338 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	SASH1	O94885	1247 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	GPATCH3	Q96I76	525 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	SETDB2	Q96T68	719 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	NYX	Q9GZU5	481 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	STAP2	Q9UGK3	403 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EFTUD2-224	ENST00000592701	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.7 ms