RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 ATAD2Q6PL18 1390 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 ITFG2Q969R8 447 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM107BQ9H098 131 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-218ENST00000590367 KRT27Q7Z3Y8 459 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 SBNO1A3KN83 1393 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 KDM4AO75164 1064 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 GTF3C6Q969F1 213 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 ATP8B1O43520 1251 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 FBLN1P23142 703 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 E2F4Q16254 413 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 TMCO3Q6UWJ1 677 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 DEFB132Q7Z7B7 95 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC189A1A4V9 331 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 KLHL33A6NCF5 533 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 ERCC3P19447 782 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 VPS72Q15906 364 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 ITPRIPQ8IWB1 547 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 PYCARDQ9ULZ3 195 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 PXDNQ92626 1479 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKARQ7Z5J8 1434 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 KIAA0232Q92628 1395 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 SLU7O95391 586 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 HMOX1P09601 288 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 CEP135Q66GS9 1140 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 FMNL3Q8IVF7 1028 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 ZRANB1Q9UGI0 708 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 NRXN1Q9ULB1 1477 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 RGS12O14924 1447 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 SMC2O95347 1197 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 IQUBQ8NA54 791 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM212AQ96EL1 285 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 LAMC1P11047 1609 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC171Q6TFL3 1326 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 GCP02774 474 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF521Q96K83 1311 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 ATG3Q9NT62 314 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 PSD3Q9NYI0 1048 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 CTAGE5O15320 804 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 MNAT1P51948 309 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 PACS2Q86VP3 889 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 EXOC4Q96A65 974 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 DRC7Q8IY82 874 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 ST7Q9NRC1 585 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 BCL9LQ86UU0 1499 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 ST18O60284 1047 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 ACTN2P35609 894 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 RARSP54136 660 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 TNNQ9UQP3 1299 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 ELF2Q15723 593 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC183Q5T5S1 534 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 WDR63Q8IWG1 891 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 LCMT1Q9UIC8 334 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 NHSL1Q5SYE7 1610 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 SHPRHQ149N8 1683 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 ADGRB1O14514 1584 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 FYB1O15117 783 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 EFCAB13Q8IY85 973 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 BAG6P46379 1132 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A1W2PP64 1363 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 LMAN1P49257 510 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 PTPN14Q15678 1187 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 AP1ARQ63HQ0 302 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 TTLL5Q6EMB2 1281 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 SPC24Q8NBT2 197 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 PTPRCP08575 1304 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 DLC1Q96QB1 1528 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 NEFHP12036 1026 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-218ENST00000590367 PRKAR2BP31323 418 aa9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms