RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRK-202ENST00000368205 NACC1Q96RE7 527 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRK-202ENST00000368205 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRK-202ENST00000368205 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PTPRK-202ENST00000368205 BHMTQ93088 406 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRK-202ENST00000368205 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRK-202ENST00000368205 RTN1Q16799 776 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRK-202ENST00000368205 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
PTPRK-202ENST00000368205 CLUAP1Q96AJ1 413 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRK-202ENST00000368205 FAM229AH3BQW9 127 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 LILRB5O75023 590 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 NKAPLQ5M9Q1 402 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 TGFBR3LH3BV60 316 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 IGFBP4P22692 258 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 PTK7Q13308 1070 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 TPSG1Q9NRR2 321 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 SLC6A14Q9UN76 642 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 GSX2Q9BZM3 304 aa9□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 FAM196BA6NMK8 535 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 DPYDQ12882 1025 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 TRAPPC3LQ5T215 181 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 NGLY1Q96IV0 654 aa8.99□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 C9orf172C9J069 976 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 GRIK4Q16099 956 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 HINFPQ9BQA5 517 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 BCS1LQ9Y276 419 aa8.98□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 A0A0A0MRY4 1105 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 ELNP15502 786 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 CCINQ13939 588 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 ILDR2Q71H61 639 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRK-202ENST00000368205 A6NJR5 290 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 USP17L15C9J2P7 530 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 USP17L10C9JJH3 530 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 USP17L12C9JPN9 530 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 USP17L11C9JVI0 530 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 USP17L21D6R901 530 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 USP17L18D6R9N7 530 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 USP17L22D6RA61 530 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 USP17L19D6RCP7 530 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 USP17L20D6RJB6 530 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 DYRK3O43781 588 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 EPB42P16452 691 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 USP17L24Q0WX57 530 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 ADGRE1Q14246 886 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 C11orf16Q9NQ32 467 aa8.96□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 SELPP16109 830 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 PNMA5Q96PV4 448 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 NAGPAQ9UK23 515 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 MAP3K6O95382 1288 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 NFKB1P19838 968 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 INPP5BP32019 993 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 RAC1P63000 192 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 PCSK7Q16549 785 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 NUDT8Q8WV74 236 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 IGFLR1Q9H665 355 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 FOXO3O43524 673 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 MBTPS1Q14703 1052 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 ARXQ96QS3 562 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 WEE1P30291 646 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 IDH3AP50213 366 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 MYO19Q96H55 970 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 FRRS1LQ9P0K9 344 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 LGR5O75473 907 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 H2AFB2P0C5Z0 115 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 ARSDP51689 593 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 TXNRD3Q86VQ6 643 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 KLK14Q9P0G3 267 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PTPRK-202ENST00000368205 DGKZQ13574 1117 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 FAM35AQ86V20 835 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRK-202ENST00000368205 DTWD1Q8N5C7 304 aa8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.9 ms