RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 AOX1Q06278 1338 aa22.64■■□□□ 1.22
SPNS1-204ENST00000352260 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.64■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 ATG3Q9NT62 314 aa22.64■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 CASC1Q6TDU7 716 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.62■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.62■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 BCL9O00512 1426 aa22.61■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 RXRBP28702 533 aa22.61■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 ATRNO75882 1429 aa22.61■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.61■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 COL15A1P39059 1388 aa22.6■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.59■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.59■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.59■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
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SPNS1-204ENST00000352260 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 VPS72Q15906 364 aa22.59■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 KIF2CQ99661 725 aa22.59■■□□□ 1.21
SPNS1-204ENST00000352260 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.58■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 A0A087WZG4 1122 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 CASP7P55210 303 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF445P59923 1031 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 USP26Q9BXU7 913 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 DDB1Q16531 1140 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 RILPL2Q969X0 211 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 ERC2O15083 957 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 H7C1W4 665 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 SASH1O94885 1247 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 STARD3NLO95772 234 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 TJP1Q07157 1748 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 REC8O95072 547 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 CHMLP26374 656 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 MCM5P33992 734 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-204ENST00000352260 BARGINQ6ZT62 677 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-204ENST00000352260 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-204ENST00000352260 SIL1Q9H173 461 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-204ENST00000352260 COPRSQ9NQ92 184 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-204ENST00000352260 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-204ENST00000352260 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-204ENST00000352260 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-204ENST00000352260 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.5■■□□□ 1.19
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SPNS1-204ENST00000352260 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
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SPNS1-204ENST00000352260 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
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SPNS1-204ENST00000352260 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-204ENST00000352260 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-204ENST00000352260 FOXO4P98177 505 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-204ENST00000352260 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-204ENST00000352260 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-204ENST00000352260 TCIRG1Q13488 830 aa22.48■■□□□ 1.19
SPNS1-204ENST00000352260 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.48■■□□□ 1.19
SPNS1-204ENST00000352260 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.48■■□□□ 1.19
SPNS1-204ENST00000352260 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-204ENST00000352260 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-204ENST00000352260 GPATCH3Q96I76 525 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-204ENST00000352260 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.47■■□□□ 1.19
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