RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329966.10

USP45-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 45, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP45, Length 1,444 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP45-202ENST00000329966 PIM2Q9P1W9 311 aa27.03■■□□□ 1.92
USP45-202ENST00000329966 H0YIN7 160 aa27.02■■□□□ 1.92
USP45-202ENST00000329966 KSR2Q6VAB6 950 aa27.02■■□□□ 1.92
USP45-202ENST00000329966 C3orf67Q6ZVT6 689 aa27.02■■□□□ 1.92
USP45-202ENST00000329966 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
USP45-202ENST00000329966 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
USP45-202ENST00000329966 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa27.01■■□□□ 1.91
USP45-202ENST00000329966 DDX58O95786 925 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
USP45-202ENST00000329966 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
USP45-202ENST00000329966 SRGNP10124 158 aa26.99■■□□□ 1.91
USP45-202ENST00000329966 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
USP45-202ENST00000329966 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
USP45-202ENST00000329966 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
USP45-202ENST00000329966 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.99■■□□□ 1.91
USP45-202ENST00000329966 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.99■■□□□ 1.91
USP45-202ENST00000329966 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.98■■□□□ 1.91
USP45-202ENST00000329966 IGKV5-2P06315 115 aa26.98■■□□□ 1.91
USP45-202ENST00000329966 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
USP45-202ENST00000329966 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
USP45-202ENST00000329966 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.98■■□□□ 1.91
USP45-202ENST00000329966 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
USP45-202ENST00000329966 FAM89AQ96GI7 184 aa26.97■■□□□ 1.91
USP45-202ENST00000329966 F6X3S4 739 aa26.96■■□□□ 1.91
USP45-202ENST00000329966 GRIN3BO60391 1043 aa26.96■■□□□ 1.91
USP45-202ENST00000329966 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
USP45-202ENST00000329966 SLC10A5Q5PT55 438 aa26.96■■□□□ 1.91
USP45-202ENST00000329966 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.96■■□□□ 1.91
USP45-202ENST00000329966 TTLL6Q8N841 843 aa26.95■■□□□ 1.9
USP45-202ENST00000329966 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
USP45-202ENST00000329966 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.95■■□□□ 1.9
USP45-202ENST00000329966 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
USP45-202ENST00000329966 CRY2Q49AN0 593 aa26.94■■□□□ 1.9
USP45-202ENST00000329966 MASTLQ96GX5 879 aa26.94■■□□□ 1.9
USP45-202ENST00000329966 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.94■■□□□ 1.9
USP45-202ENST00000329966 CACNA1FO60840 1977 aa26.94■■□□□ 1.9
USP45-202ENST00000329966 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.94■■□□□ 1.9
USP45-202ENST00000329966 STYK1Q6J9G0 422 aa26.93■■□□□ 1.9
USP45-202ENST00000329966 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.93■■□□□ 1.9
USP45-202ENST00000329966 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.92■■□□□ 1.9
USP45-202ENST00000329966 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.92■■□□□ 1.9
USP45-202ENST00000329966 NPR1P16066 1061 aa26.91■■□□□ 1.9
USP45-202ENST00000329966 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
USP45-202ENST00000329966 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
USP45-202ENST00000329966 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.9■■□□□ 1.9
USP45-202ENST00000329966 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.9■■□□□ 1.9
USP45-202ENST00000329966 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
USP45-202ENST00000329966 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
USP45-202ENST00000329966 SLX4Q8IY92 1834 aa26.89■■□□□ 1.9
USP45-202ENST00000329966 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.89■■□□□ 1.89
USP45-202ENST00000329966 SLC51AQ86UW1 340 aa26.89■■□□□ 1.89
USP45-202ENST00000329966 CNKSR1Q969H4 720 aa26.89■■□□□ 1.89
USP45-202ENST00000329966 NLRP3Q96P20 1036 aa26.89■■□□□ 1.89
USP45-202ENST00000329966 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
USP45-202ENST00000329966 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.88■■□□□ 1.89
USP45-202ENST00000329966 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.88■■□□□ 1.89
USP45-202ENST00000329966 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.88■■□□□ 1.89
USP45-202ENST00000329966 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
USP45-202ENST00000329966 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
USP45-202ENST00000329966 C21orf2O43822 256 aa26.87■■□□□ 1.89
USP45-202ENST00000329966 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
USP45-202ENST00000329966 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
USP45-202ENST00000329966 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
USP45-202ENST00000329966 OLFM4Q6UX06 510 aa26.87■■□□□ 1.89
USP45-202ENST00000329966 BEND3Q5T5X7 828 aa26.86■■□□□ 1.89
USP45-202ENST00000329966 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.86■■□□□ 1.89
USP45-202ENST00000329966 LINS1Q8NG48 757 aa26.85■■□□□ 1.89
USP45-202ENST00000329966 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
USP45-202ENST00000329966 LAMB2P55268 1798 aa26.85■■□□□ 1.89
USP45-202ENST00000329966 CACNA1SQ13698 1873 aa26.84■■□□□ 1.89
USP45-202ENST00000329966 GCKRQ14397 625 aa26.84■■□□□ 1.89
USP45-202ENST00000329966 PRELPP51888 382 aa26.82■■□□□ 1.88
USP45-202ENST00000329966 RASSF7Q02833 373 aa26.82■■□□□ 1.88
USP45-202ENST00000329966 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.82■■□□□ 1.88
USP45-202ENST00000329966 H7C1W4 665 aa26.82■■□□□ 1.88
USP45-202ENST00000329966 YY1P25490 414 aa26.82■■□□□ 1.88
USP45-202ENST00000329966 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
USP45-202ENST00000329966 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.82■■□□□ 1.88
USP45-202ENST00000329966 ABCC4O15439 1325 aa26.81■■□□□ 1.88
USP45-202ENST00000329966 PTPRCP08575 1304 aa26.81■■□□□ 1.88
USP45-202ENST00000329966 CHD4Q14839 1912 aa26.81■■□□□ 1.88
USP45-202ENST00000329966 NFKBIEO00221 500 aa26.81■■□□□ 1.88
USP45-202ENST00000329966 ALDH1B1P30837 517 aa26.81■■□□□ 1.88
USP45-202ENST00000329966 CASP7P55210 303 aa26.81■■□□□ 1.88
USP45-202ENST00000329966 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.81■■□□□ 1.88
USP45-202ENST00000329966 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
USP45-202ENST00000329966 COL4A1P02462 1669 aa26.8■■□□□ 1.88
USP45-202ENST00000329966 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
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USP45-202ENST00000329966 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
USP45-202ENST00000329966 CDHR2Q9BYE9 1310 aa26.78■■□□□ 1.88
USP45-202ENST00000329966 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
USP45-202ENST00000329966 TAF1P21675 1872 aa26.76■■□□□ 1.88
USP45-202ENST00000329966 PDE8AO60658 829 aa26.76■■□□□ 1.87
USP45-202ENST00000329966 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.76■■□□□ 1.87
USP45-202ENST00000329966 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
USP45-202ENST00000329966 SEC31BQ9NQW1 1179 aa26.75■■□□□ 1.87
USP45-202ENST00000329966 SNED1Q8TER0 1413 aa26.75■■□□□ 1.87
USP45-202ENST00000329966 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
USP45-202ENST00000329966 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
USP45-202ENST00000329966 ALDH1L1O75891 902 aa26.73■■□□□ 1.87
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