RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308271.13

USP48-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP48, Length 4,595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP48-201ENST00000308271 CALRP27797 417 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 UBASH3AP57075 661 aa22.36■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 ERO1AQ96HE7 468 aa22.36■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.36■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 CD109Q6YHK3 1445 aa22.36■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 CABP4P57796 275 aa22.36■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.36■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 DISP1Q96F81 1524 aa22.35■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.35■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 KRT24Q2M2I5 525 aa22.35■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 CCDC102BQ68D86 513 aa22.35■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.35■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.35■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.35■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 USP16Q9Y5T5 823 aa22.35■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.34■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 RUFY3Q7L099 469 aa22.34■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 MYD88Q99836 296 aa22.34■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.34■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.34■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 MBD5Q9P267 1494 aa22.34■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
USP48-201ENST00000308271 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.172e-6■■□□□ 13.2
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USP48-201ENST00000308271 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.33■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.33■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.32■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 ZNF213O14771 459 aa22.32■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 SYKP43405 635 aa22.32■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 GPT2Q8TD30 523 aa22.32■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.32■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 ABCC4O15439 1325 aa22.31■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 ALDH1L1O75891 902 aa22.31■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 ERLIN2O94905 339 aa22.31■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.31■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 TDO2P48775 406 aa22.31■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 CPLX3Q8WVH0 158 aa22.31■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 RAD50Q92878 1312 aa22.3■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 AIDAQ96BJ3 306 aa22.3■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 TMX1Q9H3N1 280 aa22.3■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 IVLP07476 585 aa22.3■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 Q6ZUG5 572 aa22.3■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.3■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 PKP1Q13835 747 aa22.3■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 ISM2Q6H9L7 571 aa22.3■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.29■■□□□ 1.16
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USP48-201ENST00000308271 KANK3Q6NY19 840 aa22.29■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 YEATS4O95619 227 aa22.29■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.29■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 ACEP12821 1306 aa22.29■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 ZNF75DP51815 510 aa22.28■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 ATL3Q6DD88 541 aa22.28■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.28■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.28■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 GOLIM4O00461 696 aa22.28■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 SGSM2O43147 1006 aa22.28■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.28■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 SPA17Q15506 151 aa22.28■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.28■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.28■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.27■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 RTL1A6NKG5 1358 aa22.27■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 G3V3G9 751 aa22.27■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.27■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.27■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 CENPHQ9H3R5 247 aa22.27■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 CBX8Q9HC52 389 aa22.27■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 RAI14Q9P0K7 980 aa22.27■■□□□ 1.16
USP48-201ENST00000308271 HSPA4P34932 840 aa22.26■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.26■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 SYNMO15061 1565 aa22.26■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.26■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.26■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.26■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 A0A087WZG4 1122 aa22.26■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 CPA1P15085 419 aa22.26■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 TUBB4BP68371 445 aa22.26■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.25■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 CHL1O00533 1208 aa22.25■■□□□ 1.15
USP48-201ENST00000308271 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
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