RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IQCB1Q15051 598 aa26.76■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 L2HGDHQ9H9P8 463 aa26.76■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FHOD1Q9Y613 1164 aa26.76■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SURF6O75683 361 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP44Q9H0E7 712 aa26.75■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARID5BQ14865 1188 aa26.75■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.74■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NR1I2O75469 434 aa26.74■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.74■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PTH1RQ03431 593 aa26.73■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 POLA2Q14181 598 aa26.73■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TPCN1Q9ULQ1 816 aa26.73■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.72■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC69A6NI79 296 aa26.72■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAP3K5Q99683 1374 aa26.72■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BICD2Q8TD16 824 aa26.72■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NECTIN1Q15223 517 aa26.71■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.71■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PLCD3Q8N3E9 789 aa26.7■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PGBD1Q96JS3 809 aa26.7■■□□□ 1.87
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TTC41PQ6P2S7 1318 aa26.7■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C3P01024 1663 aa26.7■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PLA2G4AP47712 749 aa26.69■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLCN6P51797 869 aa26.69■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC93Q567U6 631 aa26.69■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CACNA1FO60840 1977 aa26.69■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRIM34Q9BYJ4 488 aa26.68■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.68■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa26.68■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa26.68■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MUM1L1Q5H9M0 696 aa26.68■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GTF3C6Q969F1 213 aa26.68■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PSMA5P28066 241 aa26.67■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ANKRD1Q15327 319 aa26.67■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GSDMDP57764 484 aa26.66■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 STX1AQ16623 288 aa26.66■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CTAGE5O15320 804 aa26.66■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP16Q9Y5T5 823 aa26.66■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa26.65■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa26.65■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TEX35Q5T0J7 233 aa26.65■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CREB3L3Q68CJ9 461 aa26.65■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AKAP12Q02952 1782 aa26.65■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TUBB4AP04350 444 aa26.64■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BECN2A8MW95 431 aa26.64■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FOXO3O43524 673 aa26.64■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TXLNBQ8N3L3 684 aa26.64■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.64■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NPHP1O15259 732 aa26.63■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SRGAP3O43295 1099 aa26.63■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TPM4P67936 248 aa26.63■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.62■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADCY9O60503 1353 aa26.62■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KCNJ6P48051 423 aa26.62■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP26.62■■□□□ 1.856e-7■□□□□ 9.5
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UBXN6Q9BZV1 441 aa26.61■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IMPACTQ9P2X3 320 aa26.61■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRERF1Q96PN7 1200 aa26.61■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ATP8B1O43520 1251 aa26.6■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.6■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 LRRN4CLQ8ND94 238 aa26.6■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAP4K1Q92918 833 aa26.6■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CFAP45Q9UL16 551 aa26.6■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa26.6■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa26.6■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NECTIN2Q92692 538 aa26.6■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa26.6■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RESTQ13127 1097 aa26.59■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.59■■□□□ 1.85
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