RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293778.10

CXCL16-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 16, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL16, Length 2,222 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL16-201ENST00000293778 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
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CXCL16-201ENST00000293778 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
CXCL16-201ENST00000293778 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
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CXCL16-201ENST00000293778 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
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