RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	TEX35	Q5T0J7	233 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	GALNT10	Q86SR1	603 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	OR10D3	Q8NH80	312 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	10.69	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	ADGRG7	Q96K78	797 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	VDAC3	Q9Y277	283 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		10.69	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	HS3ST1	O14792	307 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	ANGPTL1	O95841	491 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	OPN1LW	P04000	364 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	GCA	P28676	217 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP5J2	P56134	94 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	OCRL	Q01968	901 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	C2orf80	Q0P641	193 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	LCP2	Q13094	533 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	TNK1	Q13470	666 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	SGCB	Q16585	318 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	PIK3R3	Q92569	461 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC9A6	Q92581	669 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	ELP4	Q96EB1	424 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338		Q9N2J8	555 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	MYNN	Q9NPC7	610 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	CAD	P27708	2225 aa		10.68	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	CXCL13	O43927	109 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	CRLF1	O75462	422 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	SLITRK5	O94991	958 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP3CB	P16298	524 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF17	P17021	662 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	PRR5	P85299	388 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	ZAR1	Q86SH2	424 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF611	Q8N823	705 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	GATS	Q8NAP1	163 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	EQTN	Q9NQ60	294 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		10.67	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF223	E7ERA6	249 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	TNFSF11	O14788	317 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	TAC1	P20366	129 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	IL11	P20809	199 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	IMPDH1	P20839	514 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	AGTR1	P30556	359 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	NTS	P30990	170 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	GABRA3	P34903	492 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	MAP3K8	P41279	467 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	GSTM5	P46439	218 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	PRKAA2	P54646	552 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	PKNOX1	P55347	436 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	CTBP2	P56545	445 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
TTLL3-233	ENST00000602338	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.3 ms