RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
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PTX4-201ENST00000293922 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PTX4-201ENST00000293922 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP16.84■□□□□ 0.29
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PTX4-201ENST00000293922 C10orf111Q8N326 155 aa16.84■□□□□ 0.29
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PTX4-201ENST00000293922 DEFB126Q9BYW3 111 aa16.84■□□□□ 0.29
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PTX4-201ENST00000293922 OR10A5Q9H207 317 aa16.84■□□□□ 0.29
PTX4-201ENST00000293922 SERHL2Q9H4I8 314 aa16.84■□□□□ 0.29
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PTX4-201ENST00000293922 PRIM2P49643 509 aa16.83■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 GZMMP51124 257 aa16.83■□□□□ 0.28
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PTX4-201ENST00000293922 ZNF321PQ8N8H1 164 aa16.83■□□□□ 0.28
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PTX4-201ENST00000293922 THTPAQ9BU02 230 aa16.83■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 ACTRT3Q9BYD9 372 aa16.83■□□□□ 0.28
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PTX4-201ENST00000293922 CD300AQ9UGN4 299 aa16.83■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 BCAP29Q9UHQ4 241 aa16.83■□□□□ 0.28
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PTX4-201ENST00000293922 RNF111Q6ZNA4 994 aa16.82■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
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PTX4-201ENST00000293922 OR10A6Q8NH74 314 aa16.82■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 C16orf52Q8NHV5 167 aa16.82■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 VMP1Q96GC9 406 aa16.82■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 C16orf58Q96GQ5 468 aa16.82■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 VSTM2LQ96N03 204 aa16.82■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 ZNF583Q96ND8 569 aa16.82■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 SPATA9Q9BWV2 254 aa16.82■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 ALG2Q9H553 416 aa16.82■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 EQTNQ9NQ60 294 aa16.82■□□□□ 0.28
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PTX4-201ENST00000293922 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
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PTX4-201ENST00000293922 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
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PTX4-201ENST00000293922 OR6C76A6NM76 312 aa16.81■□□□□ 0.28
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PTX4-201ENST00000293922 WISP2O76076 250 aa16.81■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 ETFAP13804 333 aa16.81■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 HSD17B1P14061 328 aa16.81■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 CD46P15529 392 aa16.81■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 MATN1P21941 496 aa16.81■□□□□ 0.28
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PTX4-201ENST00000293922 C4orf17Q53FE4 359 aa16.81■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 HORMAD2Q8N7B1 307 aa16.81■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 MCUR1Q96AQ8 359 aa16.81■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 C5orf34Q96MH7 638 aa16.81■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 FOLH1BQ9HBA9 442 aa16.81■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 ZGRF1Q86YA3 2104 aa16.81■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 TMEM200CA6NKL6 621 aa16.8■□□□□ 0.28
PTX4-201ENST00000293922 TTC36A6NLP5 189 aa16.8■□□□□ 0.28
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