RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
INO80B-201ENST00000233331 PIK3R3Q92569 461 aa27.96■■■□□ 2.07
INO80B-201ENST00000233331 SLC9A6Q92581 669 aa27.96■■■□□ 2.07
INO80B-201ENST00000233331 COQ8BQ96D53 544 aa27.96■■■□□ 2.07
INO80B-201ENST00000233331 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
INO80B-201ENST00000233331 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
INO80B-201ENST00000233331 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
INO80B-201ENST00000233331 THAP1Q9NVV9 213 aa27.96■■■□□ 2.07
INO80B-201ENST00000233331 FAM215AQ9Y5M1 114 aa27.96■■■□□ 2.07
INO80B-201ENST00000233331 SNX8Q9Y5X2 465 aa27.96■■■□□ 2.07
INO80B-201ENST00000233331 SCO2O43819 266 aa27.95■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 KCNH1O95259 989 aa27.95■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 IL33O95760 270 aa27.95■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 DIO3P55073 304 aa27.95■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 CLDN8P56748 225 aa27.95■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 PMPCAQ10713 525 aa27.95■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 ATG16L1Q676U5 607 aa27.95■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa27.95■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 PLCZ1Q86YW0 608 aa27.95■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 OR5P2Q8WZ92 322 aa27.95■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 RND1Q92730 232 aa27.95■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 ARL8AQ96BM9 186 aa27.95■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 DUSP26Q9BV47 211 aa27.95■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 MEAF6Q9HAF1 191 aa27.95■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 FLRT3Q9NZU0 649 aa27.95■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 UNC79Q9P2D8 2635 aa27.94■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 SNNO75324 88 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 CBR3O75828 277 aa27.94■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 NKX2-2O95096 273 aa27.94■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 C6orf47O95873 294 aa27.94■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 ACP2P11117 423 aa27.94■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 C21orf58P58505 322 aa27.94■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 C1orf185Q5T7R7 199 aa27.94■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 RTL6Q6ICC9 239 aa27.94■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 MFSD12Q6NUT3 480 aa27.94■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 ACAD11Q709F0 780 aa27.94■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 TRIM42Q8IWZ5 723 aa27.94■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa27.94■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa27.94■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 GABRA1P14867 456 aa27.93■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 LBPP18428 481 aa27.93■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 MAP3K8P41279 467 aa27.93■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 GAS1P54826 345 aa27.93■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 PGS1Q32NB8 556 aa27.93■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 OR5M10Q6IEU7 315 aa27.93■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 JADE3Q92613 823 aa27.93■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 TTYH2Q9BSA4 534 aa27.93■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 YIPF4Q9BSR8 244 aa27.93■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa27.93■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 FBXL2Q9UKC9 423 aa27.93■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 ABCG2Q9UNQ0 655 aa27.93■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 RNF6Q9Y252 685 aa27.93■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 PRIM2P49643 509 aa27.92■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 SPDYE7PQ495Y7 208 aa27.92■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 CAMKMTQ7Z624 323 aa27.92■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 ULK2Q8IYT8 1036 aa27.92■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 SLC16A11Q8NCK7 471 aa27.92■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 OR14L1PQ8NHC6 308 aa27.92■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 ASB5Q8WWX0 329 aa27.92■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 C16orf58Q96GQ5 468 aa27.92■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 TIMP4Q99727 224 aa27.92■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 UGT2B28Q9BY64 529 aa27.92■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 DPY30Q9C005 99 aa27.92■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 OR2B2Q9GZK3 357 aa27.92■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 CXorf36Q9H7Y0 433 aa27.92■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 MANSC1Q9H8J5 431 aa27.92■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 CHST11Q9NPF2 352 aa27.92■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa27.92■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 CACNA1CQ13936 2221 aa27.91■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 C17orf51A8MQB3 221 aa27.91■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 CFLARO15519 480 aa27.91■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 FADS1O60427 444 aa27.91■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 IGKV1D-16P01601 117 aa27.91■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 ALOX5P09917 674 aa27.91■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 GLI4P10075 376 aa27.91■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 KITP10721 976 aa27.91■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 BMP7P18075 431 aa27.91■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 GCKP35557 465 aa27.91■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 STX5Q13190 355 aa27.91■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 DUSP5Q16690 384 aa27.91■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 VASNQ6EMK4 673 aa27.91■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa27.91■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 LRRC34Q8IZ02 419 aa27.91■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 OR4K17Q8NGC6 315 aa27.91■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa27.91■■■□□ 2.06
INO80B-201ENST00000233331 DTNBP1Q96EV8 351 aa27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms