RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544361.1

QKI-213, Transcript of QKI, KH domain containing RNA binding, human

TSL 5

Gene QKI, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QKI-213	ENST00000544361	FAM189A1	O60320	539 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PALM	O75781	387 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	AKAP3	O75969	853 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	DDHD2	O94830	711 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SLC16A8	O95907	504 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	GPI	P06744	558 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ABHD2	P08910	425 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SPP1	P10451	314 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CTRB1	P17538	263 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PSMC3	P17980	439 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	LBP	P18428	481 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	EPOR	P19235	508 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CD22	P20273	847 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	C4BPB	P20851	252 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CD27	P26842	260 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	GTF2H1	P32780	548 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	NOV	P48745	357 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	MAPK12	P53778	367 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	TMBIM6	P55061	237 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CTAG1A	P78358	180 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	FOLH1	Q04609	750 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PPIL2	Q13356	520 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ENPP2	Q13822	863 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CYTH1	Q15438	398 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	MAPK6	Q16659	721 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	HFE	Q30201	348 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	IFI44L	Q53G44	452 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SMUG1	Q53HV7	270 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SUSD4	Q5VX71	490 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	DUPD1	Q68J44	220 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SPINK14	Q6IE38	97 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PRR27	Q6MZM9	219 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	DOK6	Q6PKX4	331 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	H2AFV	Q71UI9	128 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	LUZP2	Q86TE4	346 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ZNF410	Q86VK4	478 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SNX31	Q8N9S9	440 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	LEMD2	Q8NC56	503 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	RAD54L	Q92698	747 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ESR2	Q92731	530 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	RIT1	Q92963	219 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SPATA33	Q96N06	139 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PSKH2	Q96QS6	385 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PKP2	Q99959	881 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SNX25	Q9H3E2	840 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	AZI2	Q9H6S1	392 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SP140L	Q9H930	580 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	MARCH7	Q9H992	704 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SPG21	Q9NZD8	308 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	NUP50	Q9UKX7	468 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	3.39	□□□□□ -1.87	5e-6	■■■■■ 103.4
QKI-213	ENST00000544361	TJP1	Q07157	1748 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		3.39	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	TCHH	Q07283	1943 aa		3.38	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ITGB4	P16144	1822 aa		3.38	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361		A0A1B0GVG6	124 aa		3.38	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		3.38	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	HYKK	A2RU49	373 aa		3.38	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		3.38	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SMCO2	A6NFE2	343 aa		3.38	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SMIM23	A6NLE4	172 aa		3.38	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CENPX	A8MT69	81 aa		3.38	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	TXNDC9	O14530	226 aa		3.38	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	CTDSPL	O15194	276 aa		3.38	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	RIPK2	O43353	540 aa		3.38	□□□□□ -1.87

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