RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544361.1

QKI-213, Transcript of QKI, KH domain containing RNA binding, human

TSL 5

Gene QKI, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QKI-213	ENST00000544361	CA4	P22748	312 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	JAK1	P23458	1154 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	PKLR	P30613	574 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	HSPA1L	P34931	641 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	CHRNA7	P36544	502 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	ACADSB	P45954	432 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	SLC9A3	P48764	834 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	RGS7	P49802	495 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	KHK	P50053	298 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	PDX1	P52945	283 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	MAP3K7CL	P57077	242 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	KIAA1024L	P59773	190 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	CX3CL1	P78423	397 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	SQLE	Q14534	574 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	ZNF846	Q147U1	533 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	MTF1	Q14872	753 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	PDK3	Q15120	406 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	CDO1	Q16878	200 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	GRTP1	Q5TC63	336 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	XKRX	Q6PP77	449 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	LINGO4	Q6UY18	593 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	PEX26	Q7Z412	305 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	GPR141	Q7Z602	305 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	PIGZ	Q86VD9	579 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	BMPER	Q8N8U9	685 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	OR4C3	Q8NH37	302 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	ENKUR	Q8TC29	256 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	SEPT8	Q92599	483 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	MOB3A	Q96BX8	217 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	MUS81	Q96NY9	551 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	KCNK16	Q96T55	309 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	FEV	Q99581	238 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	COQ7	Q99807	217 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	CTRC	Q99895	268 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	CNPY3	Q9BT09	278 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	RAB34	Q9BZG1	259 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	LAT2	Q9GZY6	243 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	RMND5A	Q9H871	391 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	FETUB	Q9UGM5	382 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	IL19	Q9UHD0	177 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		3.41	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	PALLD	Q8WX93	1383 aa		3.4	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361	SLIT2	O94813	1529 aa		3.4	□□□□□ -1.86
QKI-213	ENST00000544361		A0A0D9SFI3	127 aa		3.4	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		3.4	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ILVBL	A1L0T0	632 aa		3.4	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		3.4	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		3.4	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		3.4	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361		E7EWF7	191 aa		3.4	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361		E9PQ18	207 aa		3.4	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361		I3L4J1	428 aa		3.4	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	AP3B1	O00203	1094 aa		3.4	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	RNF103	O00237	685 aa		3.4	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	PTGES	O14684	152 aa		3.4	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	KLF11	O14901	512 aa		3.4	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	ZNF609	O15014	1411 aa		3.4	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	TXNL1	O43396	289 aa		3.4	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SELENOF	O60613	162 aa		3.4	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	SNAP91	O60641	907 aa		3.4	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	JAK2	O60674	1132 aa		3.4	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	TSC22D2	O75157	780 aa		3.4	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	TM7SF2	O76062	418 aa		3.4	□□□□□ -1.87
QKI-213	ENST00000544361	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87

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