RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	TRADD	Q15628	312 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC25	Q86WR0	208 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	RDH11	Q8TC12	318 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	SMPDL3B	Q92485	455 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	OMA1	Q96E52	524 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	DACH2	Q96NX9	599 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ACOT9	Q9Y305	439 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	C17orf51	A8MQB3	221 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	TNFSF13	O75888	250 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	RCBTB2	O95199	551 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CBX7	O95931	251 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	HEXA	P06865	529 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	GSTA2	P09210	222 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	KRT15	P19012	456 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	STX2	P32856	288 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CPOX	P36551	454 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CPA2	P48052	419 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	STAR	P49675	285 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	LHX2	P50458	406 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	GFRA1	P56159	465 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAF3	Q13114	568 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	LTB4R	Q15722	352 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338		Q5PR19	223 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	MROH9	Q5TGP6	573 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	FRG2	Q64ET8	278 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ISL2	Q96A47	359 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	FRG2B	Q96QU4	278 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	SERPINI1	Q99574	410 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF639	Q9UID6	485 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	PLLP	Q9Y342	182 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A087X1B8	175 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A096LPK6	155 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM187A	A6NFU0	413 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	PLOD2	O00469	737 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	KLHL2	O95198	593 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	CLDN9	O95484	217 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	LY6G6D	O95868	133 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	TGM6	O95932	706 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP1B1	P05026	303 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	NAGA	P17050	411 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	CCKAR	P32238	428 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	PAFAH1B1	P43034	410 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	MAGEA4	P43358	317 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	PLTP	P55058	493 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	CLDN18	P56856	261 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	C2orf54	Q08AI8	447 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	NAB1	Q13506	487 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	ACAP2	Q15057	778 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-233	ENST00000602338	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		10.83	□□□□□ -0.68

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