RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF263O14978 683 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSPAN1O60635 241 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 CBR1P16152 277 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPC3P51654 580 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPL8P62917 257 aaKnown RBP-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 CNTN2Q02246 1040 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 NIPAL4Q0D2K0 466 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMARCB1Q12824 385 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 CNTN1Q12860 1018 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRT31Q15323 416 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCNG2Q16589 344 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 UNC50Q53HI1 259 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 MARCH8Q5T0T0 291 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 CASC10Q5T4H9 136 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCGF5Q86SE9 256 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 MCEMP1Q8IX19 187 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR5M1Q8NGP8 315 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 C8orf46Q8TAG6 207 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPR148Q8TDV2 347 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 PNPLA2Q96AD5 504 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 NEURL3Q96EH8 262 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNK15Q9H427 330 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLK3Q9H4B4 646 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 ALG9Q9H6U8 611 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 POLD4Q9HCU8 107 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 SH2D2AQ9NP31 389 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 EXOC1Q9NV70 894 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 PADI2Q9Y2J8 665 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 SH3GLB1Q9Y371 365 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP-1.78□□□□□ -2.69
RNU6-871P-201ENST00000516122 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1W2PPQ1 181 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF860A6NHJ4 632 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 C4orf51C9J302 202 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 MEIS2O14770 477 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCAMP1O15126 338 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 EFNA2O43921 213 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR10H3O60404 316 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNX3O60493 162 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 HCN1O60741 890 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 TBL1XO60907 577 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 SDC3O75056 442 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM63AO94886 807 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 VAMP5O95183 116 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 RBX1P62877 108 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 PITPNAQ00169 270 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 EMC2Q15006 297 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 TCEAL6Q6IPX3 200 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRR27Q6MZM9 219 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 MFSD12Q6NUT3 480 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 WDR86Q86TI4 376 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 CEP57Q86XR8 500 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMTC2Q8N394 836 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRRC75AQ8NAA5 344 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF680Q8NEM1 530 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 SAAL1Q96ER3 474 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 APOPT1Q96IL0 206 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 UBXN10Q96LJ8 280 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 TM2D1Q9BX74 207 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIM9Q9C026 710 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 GDF3Q9NR23 364 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 TAS2R16Q9NYV7 291 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 GNPTGQ9UJJ9 305 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM208BQ5VWN6 2430 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRR14LQ5THK1 2151 aa-1.79□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 TPRP12270 2363 aaKnown RBP-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMCO5BA8MYB1 307 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPIP5K2O43314 1243 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRAMEF11O60813 436 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL4P05112 153 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 SERPING1P05155 500 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRDX4Q13162 271 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC12A1Q13621 1099 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 POSTNQ15063 836 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPP2R5AQ15172 486 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 RASA2Q15283 850 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 NSDHLQ15738 373 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLEC4GQ6UXB4 293 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 MACC1Q6ZN28 852 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 NT5DC3Q86UY8 548 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 RDH10Q8IZV5 341 aa-1.8□□□□□ -2.7
RNU6-871P-201ENST00000516122 ELMOD1Q8N336 334 aa-1.8□□□□□ -2.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms