RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTBPQ96DY7 904 aa23.93■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OMA1Q96E52 524 aa23.93■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM216Q9P0N5 145 aa23.93■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLLPQ9Y342 182 aa23.93■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CBX7O95931 251 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABHD2P08910 425 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BMP5P22003 454 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTPN6P29350 595 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UQCRC1P31930 480 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TIMP3P35625 211 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WNT3P56703 355 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCAF7P61962 342 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LTB4RQ15722 352 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIPR1Q53HC9 387 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NHSL2Q5HYW2 709 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF678Q5SXM1 525 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC30A6Q6NXT4 461 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM180BQ6P0A1 224 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM81Q6P7N7 255 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZZZ3Q8IYH5 903 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAXEQ8NCW5 288 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR52R1Q8NGF1 315 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HGDQ93099 445 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC46Q96FV0 321 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF681Q96N22 645 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF382Q96SR6 550 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRODH2Q9UF12 536 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCM8Q9UJA3 840 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UTS2RQ9UKP6 389 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYT5O00445 386 aa23.91■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL2RAP01589 272 aa23.91■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BMP7P18075 431 aa23.91■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GCAP28676 217 aa23.91■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOX18P35713 384 aa23.91■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PEX19P40855 299 aa23.91■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIR2DL3P43628 341 aa23.91■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASCL1P50553 236 aa23.91■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DESI1Q6ICB0 168 aa23.91■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LCA5Q86VQ0 697 aa23.91■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 METTL6Q8TCB7 284 aa23.91■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM237Q96Q45 408 aa23.91■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NODALQ96S42 347 aa23.91■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OSBPL11Q9BXB4 747 aa23.91■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UGT2B28Q9BY64 529 aa23.91■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PFDN4Q9NQP4 134 aa23.91■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HEY2Q9UBP5 337 aa23.91■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NFU1Q9UMS0 254 aa23.91■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DLX3O60479 287 aa23.9■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ULK1O75385 1050 aa23.9■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCSK2P16519 638 aa23.9■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DRD5P21918 477 aa23.9■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HMOX2P30519 316 aa23.9■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPICP45877 212 aa23.9■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIPPLY3P57055 190 aa23.9■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNTA1Q13424 505 aa23.9■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa23.9■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EHD3Q9NZN3 535 aa23.9■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLRF1Q9NZS2 232 aa23.9■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa23.9■■□□□ 1.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNPHO15079 494 aa23.89■■□□□ 1.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDH7O60245 1069 aa23.89■■□□□ 1.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ICOSLGO75144 302 aa23.89■■□□□ 1.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UGT2B11O75310 529 aa23.89■■□□□ 1.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTAG2O75638 210 aa23.89■■□□□ 1.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL3P08700 152 aa23.89■■□□□ 1.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RHOXF2BP0C7M4 288 aa23.89■■□□□ 1.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DRD2P14416 443 aa23.89■■□□□ 1.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD1EP15812 388 aa23.89■■□□□ 1.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHN1P15882 459 aa23.89■■□□□ 1.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IMPDH1P20839 514 aa23.89■■□□□ 1.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EMDP50402 254 aa23.89■■□□□ 1.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCST1Q5T197 706 aa23.89■■□□□ 1.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NRGNQ92686 78 aa23.89■■□□□ 1.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDYHV1Q96HA8 205 aa23.89■■□□□ 1.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIB1Q96RU8 372 aa23.89■■□□□ 1.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SH3GL2Q99962 352 aa23.89■■□□□ 1.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GALNT9Q9HCQ5 603 aa23.89■■□□□ 1.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FETUBQ9UGM5 382 aa23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms