RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 MEAF6Q9HAF1 191 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 SACM1LQ9NTJ5 587 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 ASIC5Q9NY37 505 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 PRODH2Q9UF12 536 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 A0A087WV62 115 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 UPK1AO00322 258 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 KLF11O14901 512 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 SLITRK5O94991 958 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 P04436 131 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 G6PDP11413 515 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 DRD5P21918 477 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 ABCD3P28288 659 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 PIGAP37287 484 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 FBXW4P57775 412 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 KCNK10P57789 538 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 DCAF7P61962 342 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 SLC22A10Q63ZE4 541 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 RIMKLAQ8IXN7 391 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 PRR22Q8IZ63 422 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 OR2L13Q8N349 312 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 POGLUT1Q8NBL1 392 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 FAM13CQ8NE31 585 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 OR5M3Q8NGP4 307 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 PRR7Q8TB68 274 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 ELP4Q96EB1 424 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 VSTM2LQ96N03 204 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 FOLH1BQ9HBA9 442 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 PROK2Q9HC23 129 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 ZNF446Q9NWS9 450 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 CROCCQ5TZA2 2017 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 FRG2CA6NGY1 282 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 NPIPA5E9PKD4 350 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 SDHDO14521 159 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 TO15178 435 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 UNC5CO95185 931 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 PSMG1O95456 288 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 CT45A8P0DMV1 189 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 CT45A9P0DMV2 189 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 KITP10721 976 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 LAMP1P11279 417 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 ZNF24P17028 368 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 HPCAL1P37235 193 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 DNASE1L1P49184 302 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 DIO3P55073 304 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 NRG3P56975 720 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 CORO7P57737 925 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 HSPB3Q12988 150 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 CT45A2Q5DJT8 189 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 GFRALQ6UXV0 394 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 NPSR1Q6W5P4 371 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 FAM47EQ6ZV65 393 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 HSPBAP1Q96EW2 488 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 GPR137Q96N19 417 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 BTBD9Q96Q07 612 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 FAM173AQ9BQD7 235 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 TAS2R9Q9NYW1 312 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 SEC14L3Q9UDX4 400 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 NPIPA1Q9UND3 350 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-206ENST00000443528 CAPN14A8MX76 684 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-206ENST00000443528 ACOX3O15254 700 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-206ENST00000443528 HDAC3O15379 428 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-206ENST00000443528 ASNA1O43681 348 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-206ENST00000443528 SEMA7AO75326 666 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-206ENST00000443528 ERN1O75460 977 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
ACTB-206ENST00000443528 PPM1BO75688 479 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-206ENST00000443528 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
ACTB-206ENST00000443528 IFI6P09912 130 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-206ENST00000443528 NAGAP17050 411 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-206ENST00000443528 PRPS1L1P21108 318 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-206ENST00000443528 RPL3P39023 403 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
ACTB-206ENST00000443528 CDK9P50750 372 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
ACTB-206ENST00000443528 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
ACTB-206ENST00000443528 CLDN8P56748 225 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-206ENST00000443528 C21orf58P58505 322 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-206ENST00000443528 FOXO1Q12778 655 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-206ENST00000443528 RPS6KA2Q15349 733 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-206ENST00000443528 PRAMEF20Q5VT98 475 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-206ENST00000443528 DESI1Q6ICB0 168 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-206ENST00000443528 LRRC34Q8IZ02 419 aa14.45□□□□□ -0.1
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