RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RTL6Q6ICC9 239 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAOK1Q7L7X3 1001 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ISL2Q96A47 359 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FRG2BQ96QU4 278 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NTMT1Q9BV86 223 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSPYL1Q9H0U9 437 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PROK2Q9HC23 129 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCTPQ9UKL6 214 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IKBKGQ9Y6K9 419 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STX16O14662 325 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMIM24O75264 130 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 URI1O94763 535 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLPSP04118 112 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RFPL3SP0C7P2 107 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SERPINB9P50453 376 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NTRK2Q16620 822 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDH24Q86UP0 819 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CXorf21Q9HAI6 301 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALKBH4Q9NXW9 302 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AHSPQ9NZD4 102 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPRR3Q9UBC9 169 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XPR1Q9UBH6 696 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1W2PS29 197 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC3CA6NJW4 275 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRATO95237 230 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SSTR4P31391 388 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFT88Q13099 833 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAF3Q13114 568 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1orf185Q5T7R7 199 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GALNT12Q8IXK2 581 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR4K14Q8NGD5 310 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TP53INP1Q96A56 240 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAFAH2Q99487 392 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DOHHQ9BU89 302 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB26Q9HCK0 441 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 QPCTLQ9NXS2 382 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 B4GALT7Q9UBV7 327 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAPN14A8MX76 684 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TP53I11O14683 189 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT38O76015 456 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLK1P06870 262 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL6A2P12110 1019 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAGE2Q7Z2X7 111 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF441Q8N8Z8 693 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACKR4Q9NPB9 350 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAM29Q9UKF5 820 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 F8P00451 2351 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0G2JNJ9 132 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GABRA1P14867 456 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XKP51811 444 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBCELQ5QJ74 424 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C6orf163Q5TEZ5 329 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM64Q6YI46 380 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MILR1Q7Z6M3 343 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLYBLQ8N0X4 340 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LIX1Q8N485 282 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFT81Q8WYA0 676 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DIO2Q92813 273 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FMO2Q99518 471 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC6A15Q9H2J7 730 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ELOVL6Q9H5J4 265 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q9UFV3 132 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD33BA6NCL7 494 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CT62P0C5K7 136 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNTFP26441 200 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FUT7Q11130 342 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPS6KA2Q15349 733 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GGTA1PQ4G0N0 100 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SGO1Q5FBB7 561 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM198Q66K66 360 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MMGT1Q8N4V1 131 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF615Q8N8J6 731 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR4F6Q8NGB9 312 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEIL3Q8TAT5 605 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF597Q96LX8 424 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF559Q9BR84 538 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR10A5Q9H207 317 aa24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms