RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640501.1

PNKP-231, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 5

Gene PNKP, Length 151 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-231	ENST00000640501	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	STARD3NL	O95772	234 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	ANXA1	P04083	346 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	GCKR	Q14397	625 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	MYD88	Q99836	296 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	EXOC5	O00471	708 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	PTMS	P20962	102 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	SLC4A3	P48751	1232 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	PROSER3	Q2NL68	480 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	RILPL2	Q969X0	211 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PNKP-231	ENST00000640501	TNS2	Q63HR2	1409 aa		10.15	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	MCM2	P49736	904 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	ANAPC15	P60006	121 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	USP16	Q9Y5T5	823 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	USP26	Q9BXU7	913 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501		A0A087WZG4	1122 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	IGKV5-2	P06315	115 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	NFKBIB	Q15653	356 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	SUCLG2	Q96I99	432 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	DISP2	A7MBM2	1401 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	GLI3	P10071	1580 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	TICAM2	Q86XR7	235 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	EVI5L	Q96CN4	794 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	COPRS	Q9NQ92	184 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	ITGB4	P16144	1822 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	CHML	P26374	656 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	AACS	Q86V21	672 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	ATG3	Q9NT62	314 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	DDB1	Q16531	1140 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	GBP4	Q96PP9	640 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	FBXO3	Q9UK99	471 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	NRAP	Q86VF7	1730 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PNKP-231	ENST00000640501	RAD50	Q92878	1312 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	BCL9	O00512	1426 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501		H7C1W4	665 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	NBPF26	B4DH59	902 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	NUCB2	P80303	420 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	NBPF14	Q5TI25	921 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	NBPF15	Q8N660	670 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	PIGB	Q92521	554 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	GPR108	Q9NPR9	543 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	A1BG	P04217	495 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	TCIRG1	Q13488	830 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PNKP-231	ENST00000640501	KAZALD1	Q96I82	304 aa		10.06	□□□□□ -0.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms