RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637887.1

ARID1B-231, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5

Gene ARID1B, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-231	ENST00000637887	AMPD1	P23109	780 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ARID1B-231	ENST00000637887	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
ARID1B-231	ENST00000637887	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ARID1B-231	ENST00000637887	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ARID1B-231	ENST00000637887	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-231	ENST00000637887	GRIN2C	Q14957	1233 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-231	ENST00000637887	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-231	ENST00000637887	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-231	ENST00000637887	DCAF5	Q96JK2	942 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-231	ENST00000637887	MARK1	Q9P0L2	795 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
ARID1B-231	ENST00000637887	LGR5	O75473	907 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-231	ENST00000637887	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-231	ENST00000637887	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-231	ENST00000637887	SEC13	P55735	322 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-231	ENST00000637887	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-231	ENST00000637887	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-231	ENST00000637887	BTBD6	Q96KE9	485 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-231	ENST00000637887	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-231	ENST00000637887	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		10.15	□□□□□ -0.78
ARID1B-231	ENST00000637887	ADH6	P28332	368 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	POTEA	Q6S8J7	498 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		10.14	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	DPYD	Q12882	1025 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	PTK7	Q13308	1070 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		10.13	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	LAMC2	Q13753	1193 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	HINFP	Q9BQA5	517 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		10.11	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	USP17L15	C9J2P7	530 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	USP17L10	C9JJH3	530 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	USP17L12	C9JPN9	530 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	USP17L11	C9JVI0	530 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	USP17L21	D6R901	530 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	USP17L18	D6R9N7	530 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	USP17L22	D6RA61	530 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	USP17L19	D6RCP7	530 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	USP17L20	D6RJB6	530 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	USP17L24	Q0WX57	530 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	ITGB2	P05107	769 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	NGLY1	Q96IV0	654 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		10.1	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	FAM196B	A6NMK8	535 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	COL8A1	P27658	744 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	CHSY3	Q70JA7	882 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	SUSD3	Q96L08	255 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	CEP63	Q96MT8	703 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	SLC30A3	Q99726	388 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ARID1B-231	ENST00000637887	SYT9	Q86SS6	491 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ARID1B-231	ENST00000637887	DGKG	P49619	791 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ARID1B-231	ENST00000637887	CDCA8	Q53HL2	280 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ARID1B-231	ENST00000637887	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ARID1B-231	ENST00000637887	BRD7	Q9NPI1	651 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ARID1B-231	ENST00000637887	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ARID1B-231	ENST00000637887	IGHA1	P01876	353 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ARID1B-231	ENST00000637887	ARX	Q96QS3	562 aa		10.06	□□□□□ -0.8
ARID1B-231	ENST00000637887	KRBA1	A5PL33	1030 aa		10.05	□□□□□ -0.8
ARID1B-231	ENST00000637887	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
ARID1B-231	ENST00000637887	TYRO3	Q06418	890 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ARID1B-231	ENST00000637887	SPEM2	Q0P670	501 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ARID1B-231	ENST00000637887	GNB5	O14775	395 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ARID1B-231	ENST00000637887	RFX1	P22670	979 aa		10.04	□□□□□ -0.8
ARID1B-231	ENST00000637887	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
ARID1B-231	ENST00000637887	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
ARID1B-231	ENST00000637887	IGFBP4	P22692	258 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ARID1B-231	ENST00000637887	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
ARID1B-231	ENST00000637887	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ARID1B-231	ENST00000637887	ELOA3	Q8NG57	546 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ARID1B-231	ENST00000637887	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		10.03	□□□□□ -0.8
ARID1B-231	ENST00000637887	MSTN	O14793	375 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ARID1B-231	ENST00000637887	SIN3B	O75182	1162 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ARID1B-231	ENST00000637887	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ARID1B-231	ENST00000637887	MDFI	Q99750	246 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ARID1B-231	ENST00000637887	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		10.02	□□□□□ -0.81
ARID1B-231	ENST00000637887	KCNQ4	P56696	695 aa		10.01	□□□□□ -0.81
ARID1B-231	ENST00000637887	ALAS2	P22557	587 aa		10	□□□□□ -0.81
ARID1B-231	ENST00000637887	RTN1	Q16799	776 aa		10	□□□□□ -0.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69 ms