RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 CFTRP13569 1480 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 CEP164Q9UPV0 1460 aa6.13□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 ADH1AP07327 375 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 PSMD2Q13200 908 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 POTEGQ6S5H5 508 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 CNKSR1Q969H4 720 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF34Q969K3 372 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 TINF2Q9BSI4 451 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 TNIKQ9UKE5 1360 aa6.12□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 CEP162Q5TB80 1403 aa6.11□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 CBLBQ13191 982 aa6.11□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 CLN3Q13286 438 aa6.11□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 PDE3BQ13370 1112 aa6.11□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 TEAD4Q15561 434 aa6.11□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 Q6ZVU0 165 aa6.11□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 DPH6Q7L8W6 267 aa6.11□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 ATCAYQ86WG3 371 aa6.11□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.11□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.11□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.11□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.11□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.11□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.11□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 ITGAEP38570 1179 aa6.1□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP2B2Q01814 1243 aa6.1□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.1□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.1□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.1□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM52Q96A61 297 aa6.1□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.1□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 CUX1P39880 1505 aa6.09□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 NOS2P35228 1153 aa6.09□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF76P36508 570 aa6.09□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 CENPCQ03188 943 aa6.09□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 NNTQ13423 1086 aa6.09□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 TLR1Q15399 786 aa6.09□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 GJD3Q8N144 294 aa6.09□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 ABTB2Q8N961 1025 aa6.09□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 CAPN10Q9HC96 672 aa6.09□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.09□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 POLIQ9UNA4 740 aa6.09□□□□□ -1.43
CAPNS1-210ENST00000590211 ERICH3Q5RHP9 1530 aa6.09□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.08□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 PTGIRP43119 386 aa6.08□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 SPRYD7Q5W111 196 aa6.08□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.08□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.08□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 ITPKCQ96DU7 683 aa6.08□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 CFHR5Q9BXR6 569 aa6.08□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.08□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.08□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 PKD2L1Q9P0L9 805 aa6.08□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 SERTM1A2A2V5 107 aa6.07□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 BRD2P25440 801 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 GNA15P30679 374 aa6.07□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC19A1P41440 591 aa6.07□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 TNNI2P48788 182 aa6.07□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 RTN1Q16799 776 aa6.07□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.07□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 L3MBTL2Q969R5 705 aa6.07□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 KLRG1Q96E93 195 aa6.07□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 LNPKQ9C0E8 428 aa6.07□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 BCS1LQ9Y276 419 aa6.07□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.07□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 PDGFAP04085 211 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP2B1P20020 1258 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 DGKZQ13574 1117 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 IFFO2Q5TF58 517 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 NGLY1Q96IV0 654 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 AGBL1Q96MI9 1066 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 KLK14Q9P0G3 267 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 PARP3Q9Y6F1 533 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 ALDH1A1P00352 501 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 CTSHP09668 335 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 SPNS2Q8IVW8 549 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 NBPF15Q8N660 670 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 EDEM1Q92611 657 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 GMLQ99445 158 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 CABP1Q9NZU7 370 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 AK5Q9Y6K8 562 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 KIF27Q86VH2 1401 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa6.04□□□□□ -1.44
CAPNS1-210ENST00000590211 TIMP2P16035 220 aa6.04□□□□□ -1.44
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