RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MDM2-223	ENST00000536089	RASSF7	Q02833	373 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MDM2-223	ENST00000536089	PTS	Q03393	145 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MDM2-223	ENST00000536089	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	6.73	□□□□□ -1.33
MDM2-223	ENST00000536089	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	6.73	□□□□□ -1.33
MDM2-223	ENST00000536089	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MDM2-223	ENST00000536089	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MDM2-223	ENST00000536089	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MDM2-223	ENST00000536089	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		6.73	□□□□□ -1.33
MDM2-223	ENST00000536089	IGHA1	P01876	353 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MDM2-223	ENST00000536089	MPST	P25325	297 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MDM2-223	ENST00000536089	NOS2	P35228	1153 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MDM2-223	ENST00000536089	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MDM2-223	ENST00000536089	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MDM2-223	ENST00000536089	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MDM2-223	ENST00000536089	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	6.72	□□□□□ -1.33
MDM2-223	ENST00000536089	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MDM2-223	ENST00000536089	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MDM2-223	ENST00000536089	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	6.72	□□□□□ -1.33
MDM2-223	ENST00000536089	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MDM2-223	ENST00000536089	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MDM2-223	ENST00000536089	USP3	Q9Y6I4	520 aa		6.72	□□□□□ -1.33
MDM2-223	ENST00000536089	SPINT1	O43278	529 aa		6.71	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	NDUFB5	O43674	189 aa		6.71	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	TEAD4	Q15561	434 aa		6.71	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	6.71	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		6.71	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	6.71	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	6.71	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		6.71	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	6.71	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	STIM2	Q9P246	746 aa		6.71	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	COX20	Q5RI15	118 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	KANK3	Q6NY19	840 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	SV2A	Q7L0J3	742 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	SVOP	Q8N4V2	548 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	ABTB2	Q8N961	1025 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	AIDA	Q96BJ3	306 aa		6.7	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	EML1	O00423	815 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	PLA2G4A	P47712	749 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	GSK3A	P49840	483 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	ARHGAP4	P98171	946 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	BCL11A	Q9H165	835 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	SLURP2	P0DP57	97 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	DGKZ	Q13574	1117 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	GIPC2	Q8TF65	315 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	SMARCA4	P51532	1647 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	SLC35F4	A4IF30	521 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	ITGA6	P23229	1130 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	GPC1	P35052	558 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	PHKA2	P46019	1235 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	KRT76	Q01546	638 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	RTN1	Q16799	776 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	MYO19	Q96H55	970 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	ASB16	Q96NS5	453 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	NPR3	P17342	541 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	MAP3K10	Q02779	954 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	ECM1	Q16610	540 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	TTC16	Q8NEE8	873 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	KLK14	Q9P0G3	267 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	CDC14C	A4D256	554 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	TNFRSF10B	O14763	440 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	PCSK2	P16519	638 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
MDM2-223	ENST00000536089	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34

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