RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330276.4

SV2B-201, Transcript of synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SV2B, Length 11,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2B-201ENST00000330276 CHD1LQ86WJ1 897 aa6.7□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 CTAGE15A4D2H0 777 aa6.7□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 CETN3O15182 167 aa6.7□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 CTAGE8P0CG41 777 aa6.7□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 CTAGE4Q8IX94 777 aa6.7□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 CNPY4Q8N129 248 aa6.7□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 NUF2Q9BZD4 464 aa6.7□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 TRIM7Q9C029 511 aa6.7□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 TRIM35Q9UPQ4 493 aa6.7□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 SKILP12757 684 aa6.7□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 ARHGAP25P42331 645 aa6.7□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.7□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 DNAI2Q9GZS0 605 aa6.7□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 CAPZA3Q96KX2 299 aa6.7□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 DDX58O95786 925 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.7□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa6.7□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 CDKL5O76039 1030 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 RLBP1P12271 317 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 CCDC172P0C7W6 258 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 TSNARE1Q96NA8 513 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 SMIM23A6NLE4 172 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 RHOXF2BP0C7M4 288 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 RHOXF2Q9BQY4 288 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 BIN1O00499 593 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 MAP3K7CLP57077 242 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 FERMT3Q86UX7 667 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 RASAL2Q9UJF2 1139 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 HS1BP3Q53T59 392 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 SIL1Q9H173 461 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 CCDC7Q96M83 1385 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 CHMP2AO43633 222 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 BAG4O95429 457 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 LRRC45Q96CN5 670 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 TSPYL4Q9UJ04 414 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 SURF6O75683 361 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 KIF5AQ12840 1032 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 PPP2R5AQ15172 486 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 GSDMBQ8TAX9 411 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 TUBB4AP04350 444 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 VPS41P49754 854 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 ISM2Q6H9L7 571 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 RABEP2Q9H5N1 569 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.69□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 ALDH3A1P30838 453 aa6.68□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 KAT6AQ92794 2004 aa6.68□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 DMTNQ08495 405 aa6.68□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.68□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 MVPQ14764 893 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 COG7P83436 770 aa6.68□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 FSIP1Q8NA03 581 aa6.68□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 HPDP32754 393 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 TSG101Q99816 390 aa6.68□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 BCAR3O75815 825 aa6.68□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 TUBBP07437 444 aa6.68□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 CTNNA2P26232 953 aa6.68□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 CCDC40Q4G0X9 1142 aa6.68□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 PIBF1Q8WXW3 757 aa6.68□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 VEZTQ9HBM0 779 aa6.68□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.68□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 LCA5Q86VQ0 697 aa6.68□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 CCDC77Q9BR77 488 aa6.68□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 MGEA5O60502 916 aa6.67□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 TEFQ10587 303 aa6.67□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 PDE3AQ14432 1141 aa6.67□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 SEPT8Q92599 483 aa6.67□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 USP6NLQ92738 828 aa6.67□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SV2B-201ENST00000330276 NDUFAB1O14561 156 aa6.67□□□□□ -1.34
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