RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TEFQ10587 303 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SOGA3Q5TF21 947 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-201ENST00000006275 STYK1Q6J9G0 422 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NUDCQ9Y266 331 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SCN7AQ01118 1682 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RALBP1Q15311 655 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF790Q6PG37 636 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LDHDQ86WU2 507 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SRGNP10124 158 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-201ENST00000006275 AIDAQ96BJ3 306 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PASKQ96RG2 1323 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MASTLQ96GX5 879 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CAMTA2O94983 1202 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-201ENST00000006275 A1BGP04217 495 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLX4Q8IY92 1834 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-201ENST00000006275 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IL17REQ8NFR9 667 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-201ENST00000006275 VEGFBP49765 207 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCDC93Q567U6 631 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-201ENST00000006275 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-201ENST00000006275 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CLEC11AQ9Y240 323 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CACNA1SQ13698 1873 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-201ENST00000006275 C7orf43Q8WVR3 580 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HACL1Q9UJ83 578 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SCN4AP35499 1836 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NPR1P16066 1061 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRKAR2BP31323 418 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LBX1P52954 281 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-201ENST00000006275 WBP1LQ9NX94 342 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KCNQ3O43525 872 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EPHX2P34913 555 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BTBD11A6QL63 1104 aa25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BCORQ6W2J9 1755 aa25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-201ENST00000006275 USP16Q9Y5T5 823 aa25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OLFM4Q6UX06 510 aa25.05■■□□□ 1.6
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 RTKN2Q8IZC4 609 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DEFB115Q30KQ5 88 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CNTROBQ8N137 903 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RASSF10A6NK89 507 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FAM177BA6PVY3 158 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FZD9O00144 591 aa25■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NEFMP07197 916 aa25■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SYNE4Q8N205 404 aa25■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ABHD8Q96I13 439 aa25■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-201ENST00000006275 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa25■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GPC2Q8N158 579 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ALDH1B1P30837 517 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-201ENST00000006275 JDP2Q8WYK2 163 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RGL2O15211 777 aa24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FAM161AQ3B820 660 aa24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GJA3Q9Y6H8 435 aa24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NBPF26B4DH59 902 aa24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NBPF15Q8N660 670 aa24.94■■□□□ 1.58
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