RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 SGCDQ92629 289 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRAM1Q96QH2 718 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMIM14Q96QK8 99 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 PSMD1Q99460 953 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 NDFIP1Q9BT67 221 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 DPEP2Q9H4A9 486 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 C3orf14Q9HBI5 128 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 PARP11Q9NR21 331 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 NANSQ9NR45 359 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 TAS2R14Q9NYV8 317 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLIC5Q9NZA1 410 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 EHD2Q9NZN4 543 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCND2Q9NZV8 630 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNN3Q9UGI6 736 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 SIGLEC9Q9Y336 463 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A087WV62 115 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSPY2A6NKD2 308 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 A8MUA0 341 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 E7EQL1 145 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 G3V3Y1 287 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHST1O43916 411 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHV2-70P01814 119 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCCBP05166 539 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSPY3P0CV98 308 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSPY4P0CV99 314 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSPY8P0CW00 308 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSPY10P0CW01 314 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPIAL4GP0DN37 164 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 MPZP25189 248 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 UGT1A5P35504 534 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR1D4P47884 311 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 APOC4P55056 127 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ENPEPQ07075 957 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 BCL2L1Q07817 233 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACSM1Q08AH1 577 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 SYPL1Q16563 259 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCGF3Q3KNV8 242 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANO1Q5XXA6 986 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLEC17AQ6ZS10 378 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 PAQR9Q6ZVX9 377 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPP1R27Q86WC6 154 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 CADM2Q8N3J6 435 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR4C15Q8NGM1 316 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 SYNPRQ8TBG9 265 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 CACNG8Q8WXS5 425 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 USP6NLQ92738 828 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZBTB10Q96DT7 871 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAB3CQ96E17 227 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDHR1Q96JP9 859 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPR61Q9BZJ8 451 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ELOVL4Q9GZR5 314 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 SH3GLB2Q9NR46 395 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 SETD4Q9NVD3 440 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 SARDHQ9UL12 918 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNF115Q9Y4L5 304 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 PALLDQ8WX93 1383 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 HAS3O00219 553 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYL3P08590 195 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 F3P13726 295 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 HSD17B1P14061 328 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGFBP5P24593 272 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACP1P24666 158 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 UQCRFS1P47985 274 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ALDH3B2P48448 385 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 MFAP2P55001 183 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 TFAP4Q01664 338 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL18R1Q13478 541 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 GNMTQ14749 295 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 MOGAT3Q86VF5 341 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q8N976 141 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRPV3Q8NET8 790 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 TTC17Q96AE7 1141 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 SGCZQ96LD1 299 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 COQ7Q99807 217 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 FUZQ9BT04 418 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 AGXT2Q9BYV1 514 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 DCTPP1Q9H773 170 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 C10orf95Q9H7T3 257 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL1RL2Q9HB29 575 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 UVRAGQ9P2Y5 699 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 GRHPRQ9UBQ7 328 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 CUL9Q8IWT3 2517 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-871P-201ENST00000516122 DOCK8Q8NF50 2099 aa-1.7□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms