RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 MAGEA5P43359 124 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 DNASE1L1P49184 302 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 HK2P52789 917 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 AP1S2P56377 157 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 RAB38P57729 211 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 IL2P60568 153 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 PLGLB1Q02325 96 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 MYBPHQ13203 477 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 TERF2Q15554 542 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 CYP1B1Q16678 543 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 CES4AQ5XG92 561 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 NIPAL1Q6NVV3 410 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 TRILQ7L0X0 811 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 PALM2Q8IXS6 379 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 SLC35F6Q8N357 371 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 RASGEF1CQ8N431 466 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 TRPV3Q8NET8 790 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 STK35Q8TDR2 534 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 SLCO2A1Q92959 643 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 MS4A6EQ96DS6 147 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 SCYL1Q96KG9 808 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 PWWP2AQ96N64 755 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 KCNC2Q96PR1 638 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 SMC6Q96SB8 1091 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 FOXC2Q99958 501 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 HOMER3Q9NSC5 361 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 HPF1Q9NWY4 346 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 MYOTQ9UBF9 498 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 ERVK-11Q9UQG0 969 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 JRKLQ9Y4A0 524 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 NCKAP5O14513 1909 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 AKAP6Q13023 2319 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 ACANP16112 2415 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 LRIT2A6NDA9 550 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 EFCAB8A8MWE9 144 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 ZFAND5O76080 213 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 CCL3P10147 92 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 CNR1P21554 472 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 SKP1P63208 163 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF460Q14592 562 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 CEBPEQ15744 281 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 GPATCH11Q8N954 259 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 ASB15Q8WXK1 588 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 AIF1LQ9BQI0 150 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 PROK2Q9HC23 129 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 ADAP2Q9NPF8 381 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 SPRR3Q9UBC9 169 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 VWA7Q9Y334 891 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 PSAT1Q9Y617 370 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.03□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 OR14I1A6ND48 311 aa6.03□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 URADA6NGE7 173 aa6.03□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 AQP7O14520 342 aa6.03□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 BCKDKO14874 412 aa6.03□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 TAPBPO15533 448 aa6.03□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 ERI3O43414 337 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 PROM1O43490 865 aa6.03□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 ATP6AP2O75787 350 aa6.03□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 ZWINTO95229 277 aa6.03□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 ETHE1O95571 254 aa6.03□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.03□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 CD22P20273 847 aa6.03□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 SAT1P21673 171 aa6.03□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 CERS1P27544 350 aa6.03□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 PIGAP37287 484 aa6.03□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 SLC6A12P48065 614 aa6.03□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 PLA2G16P53816 162 aa6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms