RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 LPAR4Q99677 370 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 MFRPQ9BY79 579 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 SLC29A3Q9BZD2 475 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 PTGFRNQ9P2B2 879 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 STK38LQ9Y2H1 464 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 ATG4BQ9Y4P1 393 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 ASB4Q9Y574 426 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 A8MUA0 341 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 SLC28A2O43868 658 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 TYROBPO43914 113 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 ESRRBO95718 433 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 GBAP04062 536 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 PLA2G2AP14555 144 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 CPN2P22792 545 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 PPP2R1BP30154 601 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 HTR6P50406 440 aa14.72□□□□□ -0.05
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ACTB-206ENST00000443528 SLC13A2Q13183 592 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 MFAP5Q13361 173 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 EXT1Q16394 746 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 CRB2Q5IJ48 1285 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 LIPMQ5VYY2 423 aa14.72□□□□□ -0.05
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ACTB-206ENST00000443528 C18orf63Q68DL7 685 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 SLC6A19Q695T7 634 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 H3F3CQ6NXT2 135 aa14.72□□□□□ -0.05
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ACTB-206ENST00000443528 GPR180Q86V85 440 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 METTL4Q8N3J2 472 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.72□□□□□ -0.05
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ACTB-206ENST00000443528 METTL6Q8TCB7 284 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 ZBTB9Q96C00 473 aa14.72□□□□□ -0.05
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ACTB-206ENST00000443528 LMF1Q96S06 567 aa14.72□□□□□ -0.05
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ACTB-206ENST00000443528 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 EPN3Q9H201 632 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 BRF2Q9HAW0 419 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 MMP25Q9NPA2 562 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 MID1IP1Q9NPA3 183 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 MID2Q9UJV3 735 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 SLC12A4Q9UP95 1085 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 TIMM22Q9Y584 194 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 CSAG2Q9Y5P2 127 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.72□□□□□ -0.05
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ACTB-206ENST00000443528 CCDC151A5D8V7 595 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 SAGE2PA6NJ88 616 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 PROM1O43490 865 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 LDB3O75112 727 aa14.71□□□□□ -0.05
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ACTB-206ENST00000443528 FAM58BPP0C7Q3 252 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 CHN1P15882 459 aa14.71□□□□□ -0.05
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ACTB-206ENST00000443528 HMOX2P30519 316 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 ALDH3A1P30838 453 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 KRT6CP48668 564 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 AP2B1P63010 937 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 NUDT13Q86X67 352 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 ZADH2Q8N4Q0 377 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 Q8NA96 180 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 ELP5Q8TE02 316 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 TM9SF4Q92544 642 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 MECRQ9BV79 373 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 MS4A12Q9NXJ0 267 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 SENP1Q9P0U3 644 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 PHF11Q9UIL8 331 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 SPACA6W5XKT8 324 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 A0A1W2PR48 441 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 BLACEA4D250 179 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 WASHC1A8K0Z3 465 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 FGF17O60258 216 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 TRIM13O60858 407 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 ULK1O75385 1050 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 ERLIN1O75477 346 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 KLK1P06870 262 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 HSD3B1P14060 373 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-206ENST00000443528 HSD3B2P26439 372 aa14.7□□□□□ -0.06
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