RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 SCUBE1Q8IWY4 988 aa14.76□□□□□ -0.05
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ACTB-206ENST00000443528 MYRIPQ8NFW9 859 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 RDH11Q8TC12 318 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 CCDC126Q96EE4 140 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 ZNF382Q96SR6 550 aa14.76□□□□□ -0.05
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ACTB-206ENST00000443528 TRPS1Q9UHF7 1281 aa14.76□□□□□ -0.05
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ACTB-206ENST00000443528 ITGAMP11215 1152 aa14.75□□□□□ -0.05
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ACTB-206ENST00000443528 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
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ACTB-206ENST00000443528 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa14.75□□□□□ -0.05
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ACTB-206ENST00000443528 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa14.75□□□□□ -0.05
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ACTB-206ENST00000443528 ANAPC2Q9UJX6 822 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
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ACTB-206ENST00000443528 DPM1O60762 260 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 SPAG7O75391 227 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 ALPPP05187 535 aa14.74□□□□□ -0.05
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ACTB-206ENST00000443528 LCP2Q13094 533 aa14.74□□□□□ -0.05
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ACTB-206ENST00000443528 KRT71Q3SY84 523 aa14.74□□□□□ -0.05
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ACTB-206ENST00000443528 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 CCDC63Q8NA47 563 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 AGAP4Q96P64 663 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 ZIM3Q96PE6 472 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 SERPINI1Q99574 410 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 SLC17A7Q9P2U7 560 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 FBXW2Q9UKT8 454 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 SNX6Q9UNH7 406 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 SPTA1P02549 2419 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 A0A0A6YYD5 115 aa14.73□□□□□ -0.05
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ACTB-206ENST00000443528 SOX11P35716 441 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 CASRP41180 1078 aa14.73□□□□□ -0.05
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ACTB-206ENST00000443528 FRMD7Q6ZUT3 714 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 CLNKQ7Z7G1 428 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 C10orf107Q8IVU9 208 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 SIRT6Q8N6T7 355 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 M1APQ8TC57 530 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 TCP10LQ8TDR4 215 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 AGAP11Q8TF27 550 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 SELENOMQ8WWX9 145 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 FAM111AQ96PZ2 611 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-206ENST00000443528 HBEGFQ99075 208 aa14.73□□□□□ -0.05
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