RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494956.1

NELFE-213, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-213ENST00000494956 WDR34Q96EX3 536 aa9.94□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 ZNF354BQ96LW1 612 aa9.94□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 GPR78Q96P69 363 aa9.94□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 SLX1AQ9BQ83 275 aa9.94□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 RNF32Q9H0A6 362 aa9.94□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 VPS11Q9H270 941 aa9.94□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 ACSS3Q9H6R3 686 aa9.94□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 NT5DC2Q9H857 520 aa9.94□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 NMRAL1Q9HBL8 299 aa9.94□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.94□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 PRDM9Q9NQV7 894 aa9.94□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 PRDM7Q9NQW5 492 aa9.94□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 COPG2Q9UBF2 871 aa9.94□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 ACOT9Q9Y305 439 aa9.94□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 EML6Q6ZMW3 1958 aa9.94□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 A0A096LPK6 155 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 SAGE2PA6NJ88 616 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 LRRTM2O43300 516 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 PRAMEF2O60811 474 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 MYO1DO94832 1006 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 EDN3P14138 238 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 CRABP2P29373 138 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 LIM2P55344 173 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 SKP1P63208 163 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 ID2Q02363 134 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 NAB1Q13506 487 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 OR1C1Q15619 314 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 MEP1AQ16819 746 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 PFKFB4Q16877 469 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 TRIM40Q6P9F5 258 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 SCUBE1Q8IWY4 988 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 BCORP1Q8N888 145 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 TTLQ8NG68 377 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 UBTD2Q8WUN7 234 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 CAPS2Q9BXY5 557 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 MS4A8Q9BY19 250 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 OR51B5Q9H339 312 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 EHD1Q9H4M9 534 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 OPTCQ9UBM4 332 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 SLC5A6Q9Y289 635 aa9.93□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 MYO7BQ6PIF6 2116 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 A0A087X1B8 175 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 K7EPI3 171 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 CYR61O00622 381 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 B3GALT2O43825 422 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 LDB3O75112 727 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 RASAL1O95294 804 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 TYK2P29597 1187 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 PIK3CGP48736 1102 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 MTTPP55157 894 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 AP2B1P63010 937 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 SLC13A2Q13183 592 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 SETDB1Q15047 1291 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 C1QL3Q5VWW1 255 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 NIPAL1Q6NVV3 410 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 GFRALQ6UXV0 394 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 FJX1Q86VR8 437 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 ZNF227Q86WZ6 799 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 ZNF321PQ8N8H1 164 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 APCDD1LQ8NCL9 501 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 LRRN4CLQ8ND94 238 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 OR7G3Q8NG95 312 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 SUN3Q8TAQ9 357 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 DOK4Q8TEW6 326 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 NR4A3Q92570 626 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 NCLNQ969V3 563 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 C5orf34Q96MH7 638 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 SERINC2Q96SA4 455 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 PAFAH2Q99487 392 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 FMO2Q99518 471 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 EFCAB11Q9BUY7 163 aa9.92□□□□□ -0.82
NELFE-213ENST00000494956 KCMF1Q9P0J7 381 aa9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 137.8 ms