RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
ODC1-204ENST00000446285 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
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ODC1-204ENST00000446285 LRIT2A6NDA9 550 aa25.03■■□□□ 1.6
ODC1-204ENST00000446285 SAGE2PA6NJ88 616 aa25.03■■□□□ 1.6
ODC1-204ENST00000446285 HSPA7P48741 367 aa25.03■■□□□ 1.6
ODC1-204ENST00000446285 BTN3A2P78410 334 aa25.03■■□□□ 1.6
ODC1-204ENST00000446285 TUBA3CQ13748 450 aa25.03■■□□□ 1.6
ODC1-204ENST00000446285 ADPRMQ3LIE5 342 aa25.03■■□□□ 1.6
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ODC1-204ENST00000446285 TUBA3EQ6PEY2 450 aa25.03■■□□□ 1.6
ODC1-204ENST00000446285 RAPH1Q70E73 1250 aa25.03■■□□□ 1.6
ODC1-204ENST00000446285 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa25.03■■□□□ 1.6
ODC1-204ENST00000446285 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
ODC1-204ENST00000446285 AMER2Q8N7J2 671 aa25.03■■□□□ 1.6
ODC1-204ENST00000446285 SNX31Q8N9S9 440 aa25.03■■□□□ 1.6
ODC1-204ENST00000446285 FBF1Q8TES7 1133 aa25.03■■□□□ 1.6
ODC1-204ENST00000446285 CCT6BQ92526 530 aa25.03■■□□□ 1.6
ODC1-204ENST00000446285 MS4A6EQ96DS6 147 aa25.03■■□□□ 1.6
ODC1-204ENST00000446285 AICDAQ9GZX7 198 aa25.03■■□□□ 1.6
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ODC1-204ENST00000446285 A1L4Q6 167 aa25.02■■□□□ 1.6
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ODC1-204ENST00000446285 SLMAPQ14BN4 828 aa25.02■■□□□ 1.6
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ODC1-204ENST00000446285 TRIM40Q6P9F5 258 aa25.02■■□□□ 1.6
ODC1-204ENST00000446285 MDS2Q8NDY4 140 aa25.02■■□□□ 1.6
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ODC1-204ENST00000446285 RHBGQ9H310 441 aa25.02■■□□□ 1.6
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ODC1-204ENST00000446285 CCDC189A1A4V9 331 aa25.01■■□□□ 1.59
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ODC1-204ENST00000446285 B3GALT2O43825 422 aa25.01■■□□□ 1.59
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ODC1-204ENST00000446285 TERF2Q15554 542 aa25.01■■□□□ 1.59
ODC1-204ENST00000446285 OR1C1Q15619 314 aa25.01■■□□□ 1.59
ODC1-204ENST00000446285 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
ODC1-204ENST00000446285 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP25.01■■□□□ 1.599e-7■■■■■ 34.3
ODC1-204ENST00000446285 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa25.01■■□□□ 1.59
ODC1-204ENST00000446285 C8orf74Q6P047 294 aa25.01■■□□□ 1.59
ODC1-204ENST00000446285 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
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ODC1-204ENST00000446285 SLC35E2BP0CK96 405 aa25■■□□□ 1.59
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ODC1-204ENST00000446285 GFRALQ6UXV0 394 aa25■■□□□ 1.59
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ODC1-204ENST00000446285 UBE2E3Q969T4 207 aa25■■□□□ 1.59
ODC1-204ENST00000446285 SCMH1Q96GD3 660 aa25■■□□□ 1.59
ODC1-204ENST00000446285 SERINC2Q96SA4 455 aa25■■□□□ 1.59
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ODC1-204ENST00000446285 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
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ODC1-204ENST00000446285 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
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ODC1-204ENST00000446285 CLDN1O95832 211 aa24.98■■□□□ 1.59
ODC1-204ENST00000446285 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
ODC1-204ENST00000446285 MTTPP55157 894 aa24.98■■□□□ 1.59
ODC1-204ENST00000446285 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
ODC1-204ENST00000446285 RBPJQ06330 500 aa24.98■■□□□ 1.59
ODC1-204ENST00000446285 ABHD17CQ6PCB6 329 aa24.98■■□□□ 1.59
ODC1-204ENST00000446285 VN1R5Q7Z5H4 357 aa24.98■■□□□ 1.59
ODC1-204ENST00000446285 ZNF595Q8IYB9 648 aa24.98■■□□□ 1.59
ODC1-204ENST00000446285 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
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