RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 DOCK5Q9H7D0 1870 aa16.5■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 OR1E2P47887 323 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 SCARB2Q14108 478 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 LETMD1Q6P1Q0 360 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 IZUMO1Q8IYV9 350 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 KRT78Q8N1N4 520 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 UBXN10Q96LJ8 280 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 CD244Q9BZW8 370 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 SEC14L2O76054 403 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 BMP4P12644 408 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 ATP12AP54707 1039 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 GSTM4Q03013 218 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 BRAT1Q6PJG6 821 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 SLC2A11Q9BYW1 496 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 DHRS7Q9Y394 339 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 SPACA6W5XKT8 324 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 TLR4O00206 839 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 PROKR1Q8TCW9 393 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 KXD1Q9BQD3 176 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 MAGIXQ9H6Y5 334 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 UCKL1Q9NWZ5 548 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa16.49■□□□□ 0.23
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TRPC1-201ENST00000273482 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
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TRPC1-201ENST00000273482 CD1EP15812 388 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 PTCHD3Q3KNS1 767 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 PNCKQ6P2M8 343 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 VN1R5Q7Z5H4 357 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 ZSWIM9Q86XI8 627 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 ELMOD2Q8IZ81 293 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 AQP11Q8NBQ7 271 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 ELOVL2Q9NXB9 296 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 CDH7Q9ULB5 785 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 SPO11Q9Y5K1 396 aa16.49■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 IRGMA1A4Y4 181 aa16.48■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 GSAPA4D1B5 854 aa16.48■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 TSPAN4O14817 238 aa16.48■□□□□ 0.23
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TRPC1-201ENST00000273482 C17orf64Q86WR6 236 aa16.48■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 CADM3Q8N126 398 aa16.48■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 SLC46A2Q9BY10 475 aa16.48■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 CTPS2Q9NRF8 586 aa16.48■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 UPK3BL1B0FP48 263 aa16.48■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa16.48■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 UPK3BL2E5RIL1 263 aa16.48■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 TNFRSF10BO14763 440 aa16.48■□□□□ 0.23
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TRPC1-201ENST00000273482 GPRC6AQ5T6X5 926 aa16.48■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa16.48■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 IKBIPQ70UQ0 350 aa16.48■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 PLAC1Q9HBJ0 212 aa16.48■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa16.48■□□□□ 0.23
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TRPC1-201ENST00000273482 I3L521 148 aa16.48■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 SOX14O95416 240 aa16.48■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 CLCN4P51793 760 aa16.48■□□□□ 0.23
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TRPC1-201ENST00000273482 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
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TRPC1-201ENST00000273482 KDELC1Q6UW63 502 aa16.48■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 PRR23CQ6ZRP0 262 aa16.48■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 MUL1Q969V5 352 aa16.48■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
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TRPC1-201ENST00000273482 IDUAP35475 653 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 RGRP47804 291 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 OR5AK3PQ8NH89 298 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 UFD1Q92890 307 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 ATOH8Q96SQ7 321 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 FEVQ99581 238 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 GPR83Q9NYM4 423 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 AGAP5A6NIR3 686 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 TTC34A8MYJ7 566 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 CENPBD1B2RD01 187 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 CKMT1AP12532 417 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF24P17028 368 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 AMD1P17707 334 aa16.47■□□□□ 0.23
TRPC1-201ENST00000273482 STAT5AP42229 794 aa16.47■□□□□ 0.23
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