RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263012.10

NOMO3-201, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 3,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-201ENST00000263012 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ATAT1Q5SQI0 421 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 CATSPEREQ5SY80 951 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 OLIG3Q7RTU3 272 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 MARCH9Q86YJ5 346 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 OR10H4Q8NGA5 316 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 C17orf50Q8WW18 174 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 REPS1Q96D71 796 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 SLC38A2Q96QD8 506 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 KCNK12Q9HB15 430 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ACOT13Q9NPJ3 140 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ENTPD4Q9Y227 616 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 SAGP10523 405 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 SDC1P18827 310 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 DOC2AQ14183 400 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ARSIQ5FYB1 569 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 CDC73Q6P1J9 531 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 NRARPQ7Z6K4 114 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 CADM2Q8N3J6 435 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 SOCS4Q8WXH5 440 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 GATAD2BQ8WXI9 593 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 RDH12Q96NR8 316 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 GULP1Q9UBP9 304 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 DOCK5Q9H7D0 1870 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 KDELR3O43731 214 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 BPIP17213 487 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 DNAJB1P25685 340 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ETV3P41162 512 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 RAB15P59190 212 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 CTSL3PQ5NE16 218 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 LCN1P1Q5VSP4 162 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 SUV39H2Q9H5I1 410 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 TMEM138Q9NPI0 162 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa17.06■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 CLK3P49761 638 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 DAPP51397 102 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 DCDC1P59894 354 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 GRB14Q14449 540 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ARL9Q6T311 187 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 OR6C4Q8NGE1 309 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 DNASE1L2Q92874 299 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF607Q96SK3 696 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 MED28Q9H204 178 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ANKRA2Q9H9E1 313 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 DKK3Q9UBP4 350 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 LIPAP38571 399 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ASMTP46597 345 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 POMZP3Q6PJE2 187 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 COLGALT2Q8IYK4 626 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 SLC2A11Q9BYW1 496 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 DLEC1Q9Y238 1755 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 DYRK3O43781 588 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 TSPAN9O75954 239 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 AP1S1P61966 158 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 RACK1P63244 317 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 BTBD16Q32M84 506 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 BHLHB9Q6PI77 547 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 B3GLCTQ6Y288 498 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 PGBD3Q8N328 593 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 TSPEARQ8WU66 669 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 KLHL6Q8WZ60 621 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 PIK3R3Q92569 461 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ISL2Q96A47 359 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 C1orf74Q96LT6 269 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ADAM30Q9UKF2 790 aa17.05■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 E7EQ34 232 aa17.04■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 PGRMC2O15173 223 aa17.04■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 FRS3O43559 492 aa17.04■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 TSPAN6O43657 245 aa17.04■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ATG13O75143 517 aa17.04■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 SGSHP51688 502 aa17.04■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 C17orf64Q86WR6 236 aa17.04■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa17.04■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa17.04■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 TMED5Q9Y3A6 229 aa17.04■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 PPIBP23284 216 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 TGM4P49221 684 aa17.04■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 GP2P55259 537 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 MVKQ03426 396 aa17.04■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 HEPACAMQ14CZ8 416 aa17.04■□□□□ 0.32
NOMO3-201ENST00000263012 NKG7Q16617 165 aa17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms