RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562283.5

USP10-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-204ENST00000562283 GLTPD2A6NH11 291 aa22.33■■□□□ 1.17
USP10-204ENST00000562283 LMNB1P20700 586 aa22.33■■□□□ 1.17
USP10-204ENST00000562283 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.33■■□□□ 1.17
USP10-204ENST00000562283 ZPR1O75312 459 aa22.32■■□□□ 1.16
USP10-204ENST00000562283 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
USP10-204ENST00000562283 NFIXQ14938 502 aa22.32■■□□□ 1.16
USP10-204ENST00000562283 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
USP10-204ENST00000562283 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
USP10-204ENST00000562283 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.3■■□□□ 1.16
USP10-204ENST00000562283 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
USP10-204ENST00000562283 MRC1P22897 1456 aa22.29■■□□□ 1.16
USP10-204ENST00000562283 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
USP10-204ENST00000562283 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.29■■□□□ 1.16
USP10-204ENST00000562283 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.29■■□□□ 1.16
USP10-204ENST00000562283 NARFQ9UHQ1 456 aa22.29■■□□□ 1.16
USP10-204ENST00000562283 COL15A1P39059 1388 aa22.28■■□□□ 1.16
USP10-204ENST00000562283 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.28■■□□□ 1.16
USP10-204ENST00000562283 POTECB2RU33 542 aa22.28■■□□□ 1.16
USP10-204ENST00000562283 NFKBIEO00221 500 aa22.28■■□□□ 1.16
USP10-204ENST00000562283 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.28■■□□□ 1.16
USP10-204ENST00000562283 TTLL6Q8N841 843 aa22.27■■□□□ 1.16
USP10-204ENST00000562283 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.27■■□□□ 1.16
USP10-204ENST00000562283 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.27■■□□□ 1.16
USP10-204ENST00000562283 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.26■■□□□ 1.15
USP10-204ENST00000562283 SERPINB2P05120 415 aa22.26■■□□□ 1.15
USP10-204ENST00000562283 LGR6Q9HBX8 967 aa22.26■■□□□ 1.15
USP10-204ENST00000562283 SLC39A6Q13433 755 aa22.25■■□□□ 1.15
USP10-204ENST00000562283 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.25■■□□□ 1.15
USP10-204ENST00000562283 PANK3Q9H999 370 aa22.25■■□□□ 1.15
USP10-204ENST00000562283 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.25■■□□□ 1.15
USP10-204ENST00000562283 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
USP10-204ENST00000562283 IL13P35225 146 aa22.24■■□□□ 1.15
USP10-204ENST00000562283 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.24■■□□□ 1.15
USP10-204ENST00000562283 MORC1Q86VD1 984 aa22.21■■□□□ 1.15
USP10-204ENST00000562283 H0YIN7 160 aa22.2■■□□□ 1.14
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USP10-204ENST00000562283 SCN7AQ01118 1682 aa22.19■■□□□ 1.14
USP10-204ENST00000562283 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.18■■□□□ 1.14
USP10-204ENST00000562283 CACNA1SQ13698 1873 aa22.17■■□□□ 1.14
USP10-204ENST00000562283 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.17■■□□□ 1.14
USP10-204ENST00000562283 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.17■■□□□ 1.14
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USP10-204ENST00000562283 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.16■■□□□ 1.14
USP10-204ENST00000562283 SLX4Q8IY92 1834 aa22.15■■□□□ 1.14
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USP10-204ENST00000562283 POTEJP0CG39 1038 aa22.15■■□□□ 1.14
USP10-204ENST00000562283 ERFEQ4G0M1 354 aa22.15■■□□□ 1.14
USP10-204ENST00000562283 CREBZFQ9NS37 354 aa22.15■■□□□ 1.14
USP10-204ENST00000562283 C21orf2O43822 256 aa22.14■■□□□ 1.13
USP10-204ENST00000562283 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.14■■□□□ 1.13
USP10-204ENST00000562283 CHADLQ6NUI6 762 aa22.14■■□□□ 1.13
USP10-204ENST00000562283 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
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USP10-204ENST00000562283 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.132e-6■□□□□ 8.5
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USP10-204ENST00000562283 PDE6BP35913 854 aa22.11■■□□□ 1.13
USP10-204ENST00000562283 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
USP10-204ENST00000562283 A0A087WZG4 1122 aa22.1■■□□□ 1.13
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USP10-204ENST00000562283 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.1■■□□□ 1.13
USP10-204ENST00000562283 SCN4AP35499 1836 aa22.1■■□□□ 1.13
USP10-204ENST00000562283 FOXN1O15353 648 aa22.09■■□□□ 1.13
USP10-204ENST00000562283 STARD3NLO95772 234 aa22.09■■□□□ 1.13
USP10-204ENST00000562283 CNTNAP1P78357 1384 aa22.09■■□□□ 1.13
USP10-204ENST00000562283 BCORQ6W2J9 1755 aa22.08■■□□□ 1.13
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USP10-204ENST00000562283 PASKQ96RG2 1323 aa22.07■■□□□ 1.12
USP10-204ENST00000562283 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
USP10-204ENST00000562283 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
USP10-204ENST00000562283 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.07■■□□□ 1.12
USP10-204ENST00000562283 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.06■■□□□ 1.12
USP10-204ENST00000562283 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.06■■□□□ 1.12
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USP10-204ENST00000562283 CNKSR1Q969H4 720 aa22.04■■□□□ 1.12
USP10-204ENST00000562283 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.04■■□□□ 1.12
USP10-204ENST00000562283 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.03■■□□□ 1.12
USP10-204ENST00000562283 ZNF790Q6PG37 636 aa22.03■■□□□ 1.12
USP10-204ENST00000562283 LDHDQ86WU2 507 aa22.03■■□□□ 1.12
USP10-204ENST00000562283 CNBD1Q8NA66 436 aa22.03■■□□□ 1.12
USP10-204ENST00000562283 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
USP10-204ENST00000562283 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
USP10-204ENST00000562283 CAMTA2O94983 1202 aa22.02■■□□□ 1.12
USP10-204ENST00000562283 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
USP10-204ENST00000562283 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.01■■□□□ 1.11
USP10-204ENST00000562283 IL17REQ8NFR9 667 aa22.01■■□□□ 1.11
USP10-204ENST00000562283 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.01■■□□□ 1.11
USP10-204ENST00000562283 SETDB2Q96T68 719 aa22.01■■□□□ 1.11
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